Berikut adalah daftar sungai di Sudan Selatan.

Sungai 
 Sungai Akobo
 Sungai Bahr el Ghazal
 Bahr el Zeraf
 Sungai Baro
 Sungai Jur
 Sungai Kangen
 Sungai Kidepo
 Sungai Kiir
 Sungai Kongkong
 Sungai Koss
 Sungai Kuru
 Sungai Lol
 Sungai Lotilla
 Sungai Pibor
 Sungai Pongo
 Sungai Sobat
 Sungai Sopo
 Sungai Wau
 Sungai Nil Putih

Lihat Juga 
 Daftar sungai di Afrika
 Daftar sungai di Sudan

Pranala luar 
 Southern Sudan Topography 

Sudan Selatan
Sungai di Sudan Selatan