Berikut adalah daftar perguruan tinggi yang mengajarkan program studi pertanian (dalam arti luas, yang termasuk di dalamnya adalah peternakan, perikanan, kehutanan, sosial ekonomi pertanian, dan teknologi pertanian) di Indonesia:

Aceh 
 Akademi Perikanan Dan Ilmu Kelautan, Banda Aceh
 Sekolah Tinggi Ilmu Kehutanan Pante Kulu, Banda Aceh
 Sekolah Tinggi Ilmu Pertanian Yashafa, Singkil
 Sekolah Tinggi Pertanian Gajah Putih, Takengon, Aceh Tengah
 Sekolah Tinggi Pertanian Gunung Leuser, Kutacane, Aceh Tenggara
 Sekolah Tinggi Pertanian YP Tgk Dirundeng Meulaboh, Meulaboh, Kabupaten Aceh Barat
 Universitas Serambi Mekkah
 Universitas Syiah Kuala, Banda Aceh
 Universitas Teuku Umar, Meulaboh

Sumatera Utara 
 Sekolah Tinggi Ilmu Pertanian Agribisnis Perkebunan, Medan
 Tinggi Ilmu Pertanian Labuhan Batu, Rantau Prapat, Kabupaten Labuhanbatu
 Sekolah Tinggi Penyuluhan Pertanian Medan, Medan
 Sekolah Tinggi Perikanan Dan Kelautan Sibolga, Sibolga
 Sekolah Tinggi Pertanian Benteng Huraba, Padang Sidempuan, Kabupaten Tapanuli Selatan
 Universitas Islam Sumatera Utara, Medan
 Universitas Katolik Santo Thomas, Medan
 Universitas Muhammadiyah, Medan
 Universitas Preston (Indonesia), Medan
 Universitas Quality, Medan
 Universitas Simalungun, Pematangsiantar
 Universitas Sumatera Utara, Medan
 Akademi Komunitas Negeri Kabupaten Nias Utara

Sumatera Barat 
 Akademi Pembangunan Pertanian, Lubuk Alung, Padang Pariaman
 Politeknik Pertanian Negeri Payakumbuh, Payakumbuh
 Universitas Andalas, Padang
 Universitas Ekasakti, Padang

Bengkulu 
 Sekolah Tinggi Ilmu Pertanian Rejang Lebong, Curup, Kabupaten Rejang Lebong
 Universitas Bengkulu, Bengkulu
 Universitas Dehasen, Bengkulu

Riau 
 Politeknik Pertanian Tembilahan, Tembilahan, Indragiri Hilir
 Sekolah Tinggi Ilmu Pertanian Swarna Dwipa, Teluk Kuantan, Kuantan Singingi
 Universitas Islam Indragiri, Tembilahan
 Universitas Pasir Pangaraian
 Universitas Riau, Pekanbaru

Kepulauan Riau 
 Universitas Maritim Raja Ali Haji, Tanjungpinang

Jambi 
 Sekolah Tinggi Ilmu Pertanian Graha Karya, Batanghari
 Universitas Batanghari, Jambi
 Universitas Jambi, Jambi
 Universitas Muara Bungo, Muara Bungo

Sumatera Selatan 
 Akademi Perikanan Wachyuni Mandira, Kota Palembang
 Sekolah Tinggi Ilmu Pertanian Bumi Silampari, Lubuklinggau
 Sekolah Tinggi Ilmu Pertanian Sriwigama, Palembang
 Sekolah Pertanian Pembangunan Sembawa, Sembawa
 Sekolah Tinggi Pertanian Belitang, Belitang, Kabupaten Ogan Komering Ulu Timur
 Universitas Muhammadiyah Palembang, Palembang
 Universitas Sriwijaya, Palembang

Lampung 
 Politeknik Negeri Lampung
 Politeknik Pertanian Negeri Lampung
 Sekolah Tinggi Ilmu Pertanian Dharma Wacana, Kota Metro
 Sekolah Tinggi Ilmu Pertanian Surya Dharma, Kota Bandar Lampung
 Sekolah Tinggi Perkebunan Lampung, Kota Bandar Lampung
 Universitas Lampung, Bandar Lampung

Kepulauan Bangka Belitung 
 Sekolah Tinggi Ilmu Pertanian Bangka, Sungailiat, Kabupaten Bangka

Jakarta 
 Akademi Pertamanan Interstudi
 Universitas Mercu Buana
 Universitas Borobudur

Jawa Barat 
 Institut Pertanian Bogor, Bogor
 Politeknik Agroindustri, Subang
 Sekolah Tinggi Ilmu Pertanian YPPM, Majalengka
 Sekolah Tinggi Penyuluhan Pertanian Bogor, Bogor
 Universitas Bale Bandung, Bandung
 Sekolah Tinggi Pertanian Jawa Barat, Bandung
 Universitas Bandung Raya, Bandung
 Universitas Djuanda, Bogor
 Universitas Islam Nusantara, Bandung
 Universitas Nusa Bangsa, Bogor
 Universitas Padjadjaran, Bandung
 Universitas Pasundan, Bandung
 Universitas Subang, Subang
 Universitas Winaya Mukti, Sumedang
 Universitas Swadaya Gunung Jati, Cirebon
 Universitas Majalengka, Majalengka
 Universitas Siliwangi, Tasikmalaya

Banten 
 Institut Teknologi Indonesia Serpong, Tangerang
 Universitas Islam Negeri Syarif Hidayatullah Jakarta, Tangerang Selatan
 Universitas Sultan Ageng Tirtayasa, Serang
Politeknik Enjiniring Pertanian Indonesia, Serpong, Tangerang Selatan

Jawa Tengah 
 Akademi Perikanan Baruna, Slawi
 Akademi Perikanan dan Kelautan Sri Mukti, Cilacap
 Akademi Pertanian HKTI Banyumas, Purwokerto
 Akademi Perikanan Kalinyamat, Jepara
 Akademi Pertanian Muhammadiyah Pemalang, Pemalang
 Akademi Pertanian Pandanaran Boyolali, Boyolali
 Akademi Pertanian PGRI Wonosobo, Wonosobo
 Akademi Pertanian Pragolapati, Pati
 Akademi Peternakan Karanganyar, Karanganyar
 Sekolah Tinggi Penyuluhan Pertanian Magelang, Magelang
 Sekolah Tinggi Ilmu Perikanan Kalinyamat, Jepara
 Sekolah Tinggi Ilmu Pertanian Farming, Semarang
 Universitas Boyolali, Surakarta
 Universitas Diponegoro, Semarang
 Universitas Jenderal Soedirman, Purwokerto
 Universitas Katolik Soegijapranata, Semarang
 Universitas Kristen Satya Wacana, Salatiga
 Universitas Negeri Sebelas Maret, Surakarta
 Universitas Slamet Riyadi, Surakarta
 Universitas Wahid Hasyim, Semarang
 Universitas Widya Dharma, Klaten
 Universitas Muhammadiyah Purworejo, Purworejo

Yogyakarta 
 Akademi Perikanan Yogyakarta, Yogyakarta
 Akademi Pertanian Yogyakarta, Sleman
 Akademi Peternakan Brahmaputra, Yogyakarta
 Lembaga Pendidikan Perkebunan, Yogyakarta
 Institut Pertanian Yogyakarta, Yogyakarta
 Institut Pertanian Stiper, Yogyakarta
 Universitas Gadjah Mada, Yogyakarta
 Universitas Janabadra, Yogyakarta
 Universitas Muhammadiyah Yogyakarta, Yogyakarta
 Universitas Pembangunan Nasional "Veteran" Yogyakarta, Yogyakarta
 Universitas Semarang, Yogyakarta

Jawa Timur 
 Akademi Kelautan Banyuwangi, Banyuwangi
 Akademi Perikanan Ibrahimy, Situbondo
 Akademi Perikanan PGRI, Tuban
 Institut Pertanian Malang, Malang
 Politeknik Negeri Jember, Jember
 Sekolah Tinggi Penyuluhan Pertanian Malang, Malang
 Sekolah Tinggi Ilmu Perikanan Malang, Malang
 Sekolah Tinggi Ilmu Pertanian, Jember
 Universitas Airlangga, Surabaya
 Universitas Brawijaya, Malang
 Universitas Katolik Widya Karya, Malang
 Universitas Kristen Cipta Wacana, Malang
 Universitas Jember, Jember
 Universitas Muhammadiyah Gresik, Gresik
 Universitas Muhammadiyah Malang, Malang
 Universitas Muhammadiyah Sidoarjo, Sidoarjo
 Universitas Pembangunan Nasional "Veteran" Jawa Timur, Kota Surabaya
 Universitas PGRI Banyuwangi, Kota Banyuwangi
 Universitas Tribhuwana Tungga Dewi, Malang
 Universitas Trunojoyo, Bangkalan, Madura
 Universitas Widya Gama, Malang
 Universitas Wijaya Kusuma, Surabaya
 Universitas Yudharta, Pasuruan

Kalimantan Tengah 
 Universitas Palangka Raya, Palangka Raya
 Sekolah Tinggi Pertanian Pgri Buntok, Buntok, Barito Selatan
 Universitas Kristen Palangka Raya, Palangka Raya

Kalimantan Selatan 
 Politeknik Islam Syekh Salman Al-Farisi, Kabupaten Tapin
 Politeknik Tanah Laut, Pelaihari, kabupaten Tanah Laut
 Politeknik Terpikat Sambas, Kota Sambas
 Sekolah Tinggi Ilmu Pertanian Amuntai, Amuntai
 Sekolah Pertanian Pembangunan Banjarbaru, Banjarbaru
 Universitas Lambung Mangkurat, Banjarbaru

Kalimantan Timur 
 Politeknik Pertanian Negeri Samarinda, Samarinda
 Sekolah Tinggi Pertanian, Kutai Timur
 Universitas Mulawarman, Samarinda
 Sekolah Tinggi Ilmu Pertanian Berau, Berau

Kalimantan Barat 
 Akademi Manajemen Agribisnis, Sanggau
 Akademi Agrobisnis Bumi Sebalo, Bengkayang
 Politeknik Tonggak Equator, Pontianak
 Politeknik Negeri Pontianak, Pontianak
 Sekolah Tinggi Pertanian Panca Bhakti, Pontianak
 Universitas Tanjungpura, Pontianak

Bali 
 Universitas Udayana
Universitas Dwijendra

Nusa Tenggara Timur 
 Politeknik Pertanian Negeri, Kupang
 Sekolah Pertanian Pembangunan Kupang, Kupang
 Universitas Kristen Artha Wacana, Kupang
 Universitas Nusa Nipa, Maumere, Flores
 Universitas Tribuana Kalabahi, Kabupaten Alor

Nusa Tenggara Barat 
 Universitas Mataram, Kota Mataram
 Universitas Muhammadiyah Mataram, Kota Mataram

Sulawesi Barat 
 Sekolah Tinggi Ilmu Pertanian Tanratupattanabali, Mamuju
 Universitas Sulawesi Barat, Mamasa

Sulawesi Utara 
 Universitas Katolik De La Salle, Manado
 Universitas Kristen Indonesian, Tomohon
 Universitas Nusantara, Manado
 Universitas Sam Ratulangi, Manado
 Universitas Sari Putra, Tomohon
 Universitas Teknologi Sulawesi Utara, Manado

Sulawesi Tengah 
 Sekolah Tinggi Ilmu Pertanian Mujahidin Toli-Toli, Toli-Toli
 Sekolah Tinggi Perikanan dan Ilmu Kelautan Palu, Palu
 Politeknik Palu, Palu
 Universitas Alkhairaat, Palu
 Universitas Tadulako, Palu

Sulawesi Selatan 
 Sekolah Tinggi Ilmu Pertanian Cokrominoto Palopo, Palopo
 Universitas Puangrimanggalatung, Sengkang, Wajo
 Sekolah Tinggi Ilmu Pertanian Yapi Pinrang, Pinrang
 Sekolah Tinggi Ilmu Pertanian Yapim Maros, Maros
 Sekolah Tinggi Penyuluhan Pertanian Gowa, Gowa
 Sekolah Tinggi Teknik Kelautan Balik Diwa, Makassar
 Universitas Cokroaminoto, Makassar
 Universitas Hasanudin, Makassar
 Universitas Andi Djemma Palopo
 Universitas Indonesia Timur, Makassar
 Universitas Pancasakti, Makassar
 Universitas Islam Makassar,
 Universitas Negeri Makassar, Makassar

Sulawesi Tenggara 
 Sekolah Tinggi Ilmu Pertanian Kendari, Kendari
 Sekolah Tinggi Ilmu Pertanian Muna Raha, Kota Raha
 Universitas Haluoleo, Kendari
 Universitas Kendari, Kendari
 Universitas Sembilan Belas November, Kolaka

Gorontalo 
 Universitas Negeri Gorontalo, Kota Gorontalo
 Politeknik Gorontalo, Kota Gorontalo
 Universitas Gorontalo, Kota Gorontalo
 Universitas Ichsan Gorontalo, Kota Gorontalo

Maluku 
 Sekolah Tinggi Pertanian Hatta-Sjahrir, Banda Naira
 Universitas Pattimura, Ambon

Maluku Utara 
 Universitas Khairun, Ternate

Papua 
 Akademi Perikanan Kamasan Biak, Biak, Biak Numfor
 Politeknik Pertanian Yasanto, Merauke
 Sekolah Tinggi Ilmu Pertanian Santo Thomas, Jayapura
 Universitas Cenderawasih, Jayapura
 Universitas Musamus, Merauke

Papua Barat 
 Akademi Perikanan Sorong, Sorong
 Sekolah Tinggi Penyuluhan Pertanian Manokwari, Manokwari
 Universitas Negeri Papua, Manokwari

Lihat pula 

 Daftar perguruan tinggi pertanian
 Daftar sekolah pelayaran di Indonesia

Pranala luar 

 Lembaga Pendidikan Pertanian.  Kementerian Pertanian Republik Indonesia

Daftar bertopik pertanian