Berikut ini adalah daftar sungai di Jawa Timur:

Menurut abjad 
 Kali/Sungai Banyupahit

 Kali/Sungai Bedadung

 Bengawan Madiun
 Bengawan Solo
 Kali/Sungai Brantas

 Kali/Sungai Grindulu

 Kali/Sungai Jagir

 Kali/Sungai Konto

 Kali/Sungai Mas

 Kali/Sungai Porong

 Kali/Sungai Sanen

 Kali/Sungai Setail

 Kali/Sungai Widas

Menurut pulau

Di bagian pulau Jawa

Pulau Madura 

</onlyinclude>

Lihat pula 
 Daftar daerah aliran sungai di Indonesia
 Daftar sungai di Indonesia
 Daftar sungai di Jawa
 Wilayah sungai

Referensi 

 
Jawa Timur
Jawa Timur