mengapa disebut kitab kuning? ... “Yaa karena kertasnya berwarna kuning”,, begitulah kiranya jawaban paling mudah untuk menjawab tentang apa itu kitab kuning. Kitab kuning identik dengan dunia pesantren. Di pesantren, mempelajari kitab kuning adalah hal wajib bahkan ada motivasi khusus dari para santri untuk memutuskan mondok yaitu “aku ingin ke pondok untuk mempelajari kitab kuning”.
Bagi santri yang sudah benar-benar menguasai isi kitab kuning setelah diuji oleh para pengasuh maka pimpinan (kyai) pondok memberikannya ijasah. Ijasah adalah sebuah pengakuan bahwa yang bersangkutan sudah benar-benar menguasai isi kitab. Tradisi pembelajaran diatas menjadi tradisi pondok pesantren khususnya pesantren salaf.
Tidak seperti pondok modern yang menggabungkan antara ilmu agama dan ilmu umum. Trensains mengambil kekhususan pada pemahaman al-Quran, sains ke-alam-an dan interaksinya. Poin terakhir, interaksi antara agama dan sains merupakan materi khas trensains dan tidak ada dalam ponpes modern.Kemampuan bahasa Arab dan bahasa Inggris menjadi kemampuan dasar bagi para santri. Selain menjadi alat komunikasi, di Trensains bahasa Arab juga digunakan sebagai alat analisis awal dalam menalar ayat-ayat al-Quran khususnya ayat-ayat kauniyah.