İstanbul'da, Büyük İstanbul Otogarı'nın ardından şehirlerarası yolcu taşıyan otobüslerin kalktığı en büyük ikinci terminal olan Harem Otogarı Harem'de yer alır. Semtte ayrıca İDO tarafından işletilen ve Boğaz'ın ve karşı yakasındaki Sirkeci'ye ulaşan düzenli araba vapuru seferleri yapılmaktadır. Semtteki otogar bir bağlantı yoluyla D100 karayoluna bağlanmaktadır. Semtin komşuları batıda İstanbul Boğazı, doğuda Koşuyolu, güneyde Haydarpaşa ve kuzeyde Salacak'tır.