Federer, 23 Temmuz'da dünyaya gelen ikiz kızları Charlene Riva ve Myla Rose'un ilk fotoğraflarını, Facebook'ta yayımladı. Bir kızı eşi Mirka'nın, diğeri de kendi kollarında olan kızlarıyla babasının objektifine gülümseyen Federer, fotoğrafın altına yaptığı yorumda, “Biz, kızlarla düzgün bir fotoğraf çektirmeye çalışırken, onların hıçkırıp durması, çok komikti” ifadelerini kullandı. Federer, yakınlarına ve hayranlarına, gösterdikleri ilgiden ötürü teşekkür etti.
27 yaşındaki Federer, Mart ayında hamileliğini duyurduğu eşi Mirka ile Nisan ayında evlenmiş, ancak ikiz bebek beklediklerini kamuoyundan saklamıştı.
Federer, kendisi gibi tenisçi olan eşi Mirka ile 2000 yılında Sydney Olimpiyatları'na hazırlanırken tanışmıştı. Sakatlığı nedeniyle kortlara veda eden Mirka, Federer'in menajerliğini yürütüyor.