Burgos şehrinde Akdeniz iklim koşulları etkilidir. Ancak yüksek rakımlı bir alanda ve denizden uzakta konumlandığından şehirde kışlar oldukça soğuk ve karlıdır. Yılın en soğuk ayı olan ocakta ortalama hava sıcaklığı -10 – 0 derece iken, en sıcak ay Temmuzda ortalama 23 – 27 derecede seyretmektedir. Burgos’u ziyaret etmek için en uygun dönem Nisan – Mayıs ve Eylül – Ekim aylarıdır.