İki Virüs Vücutta Nasıl Birleşir?
Coronavirus Ve İki Virüsün Birleşmiş Olabileceğini Düşünülmektedir.
Birkaç hafta içinde hepimiz COVID-19 ve buna neden olan virüs hakkında çok şey öğrendik. SARS-CoV-2. Ama aynı zamanda birçok söylenti var. Ve bu virüs hakkındaki bilimsel makale sayısı artarken, kökenleri konusunda hala birçok sorunlu alan var.
Hangi hayvan türlerinde meydana geldi? Bir yarasa, bir pangolin veya başka bir vahşi tür? Nereden geliyor? Çin’in Hubei eyaletindeki bir mağaradan mı yoksa ormandan mı?
Aralık 2019’da, hastaneye kaldırılan ilk 41 kişiden 27’si (% 66) Hubei eyaletindeki Wuhan şehrinin kalbinde yer alan bir pazardan olduğunu. Ancak, Wuhan Hastanesi’nde yapılan bir araştırmaya göre, tespit edilen ilk insan vakası bu pazara gelmediği. Bunun yerine, SARS-CoV-2 genomik dizilerine dayanan moleküler bir tarih tahmini, Kasım ayında bir kökene işaret eder. Bu, bu COVID-19 salgını ile yaban hayatı arasındaki bağlantı hakkında sorular doğurmaktadır.
Genomik veriler
SARS-CoV-2 genom hızla Çinli araştırmacılar tarafından dizildi. Bulunan bir proteini kodlayan S geni de dahil olmak üzere 15 gen içeren yaklaşık 30.000 baz içeren bir RNA molekülüdür (karşılaştırma için, genomumuz yaklaşık 3 milyar baz DNA çift sarmalı formundadır ve yaklaşık 30.000 gen içerir).
Karşılaştırmalı genomik analizler, SARS-CoV-2’nin Betacoronavirüs grubuna ait olduğunu ve Kasım 2002’de Çin’in Guangdong eyaletinde ortaya çıkan ve daha sonra yayılan akut pnömoni salgınından sorumlu olan SARS- CoV’ye çok yakın olduğunu göstermiştir. 2003 yılında 29 ülke. 774 ölüm dahil toplam 8.098 vaka kaydedildi. Rhinolophus cinsinin yarasalarının (potansiyel olarak birkaç mağara türü) bu virüsün rezervuarı olduğu ve küçük bir etoburun, palmiye misk kedisinin ( Paguma larvata ) yarasalar ve ilk insan vakaları arasında bir ara konakçı olarak hizmet ettiği bilinmektedir.
O zamandan beri, çoğunlukla yarasalarda değil, insanlarda da birçok Betacoronavirüs keşfedildi. Örneğin, Çin’in Yunan eyaletinde toplanan Rhinolophus affinis türünün bir yarasasından izole edilen RaTG13, yakın zamanda SARS-CoV-2’ye çok benzer olarak tanımlanmıştır ve genom sekansları% 96 ile aynıdır. Bu sonuçlar yarasaların ve özellikle Rhinolophus cinsinin türlerinin SARS-CoV ve SARS-CoV-2 virüslerinin rezervuarını oluşturduğunu göstermektedir.
Ancak bir rezervuarı nasıl tanımlarsınız? Bir rezervuar, doğal olarak bir veya birkaç virüsü barındıracak, virüse karşı çok hassas olmayan veya çok hassas olmayan bir veya birkaç hayvan türüdür. Hastalığın semptomlarının yokluğu, çok fazla viral proliferasyona karşı savaşmalarını sağlayan bağışıklık sistemlerinin etkinliği ile açıklanmaktadır.
Rekombinasyon mekanizması
7 Şubat 2020’de, pangolin’de SARS-CoV-2’ye daha yakın bir virüsün bulunduğunu öğrendik. Genomik uyumun % 99’u rapor edildiğinde, bu, yarasalardan daha muhtemel bir rezervuar önerdi. Bununla birlikte, incelenmekte olan yeni bir çalışma, Malezya pangolininden ( Manis javanica ) izole edilen koronavirüs genomunun, sadece% 90 genomik uyumla SARS-Cov-2’ye daha az benzer olduğunu göstermektedir. Bu, pangolin içinde izole edilen virüsün şu anda şiddetli olan COVID-19 salgından sorumlu olmadığını gösterecektir.
Bununla birlikte, pangolin’den izole edilen koronavirüs, S proteininin belirli bir bölgesinde% 99 oranında benzerdir; bu, virüsün girmesine izin veren ACE (Anjiyotensin Dönüştürücü Enzim 2) reseptör bağlanma alanında yer alan 74 amino aside karşılık gelir. onları enfekte etmek için insan hücreleri. Buna karşılık, yarasa R. affinis’ten izole edilen RaTG13 virüsü bu spesifik bölgede oldukça farklıdır (benzerliğin sadece% 77’si). Bu, pangolin’den izole edilen koronavirüsün insan hücrelerine girebildiği, ancak yarasa R. affinis’ten izole edilenin bulunmadığı anlamına gelir.
Ek olarak, bu genomik karşılaştırmalar, SARS-Cov-2 virüsünün biri RaTG13’e ve diğeri pangolin virüsüne daha yakın olan iki farklı virüs arasındaki rekombinasyonun bir sonucu olduğunu göstermektedir. Başka bir deyişle, önceden var olan iki virüs arasındaki bir kimeradır.
Bu rekombinasyon mekanizması, özellikle SARS-CoV’nin kökenini açıklamak için koronavirüslerde zaten tarif edilmişti. Rekombinasyonun potansiyel olarak yeni bir konakçı türü enfekte edebilecek yeni bir virüsle sonuçlandığını bilmek önemlidir. Rekombinasyonun meydana gelmesi için, iki ıraksak virüs aynı anda aynı organizmayı enfekte etmiş olmalıdır.
İki soru cevapsız kaldı: bu rekombinasyon hangi organizmada meydana geldi? (bir yarasa, bir pangolin veya başka bir tür?) Ve her şeyden önce, bu rekombinasyon hangi koşullar altında gerçekleşti?