Kırmızı daire ülkeden doğan güneş ifade eder. Ülkenin adı ‘güneşin kaynağı’ anlamına gelen Japonya’da güneş, milli simgelerin en önemlilerinden biridir. Japon mitolojisine göre güneşin tanrıçası Amaterasu da Japon tanrılarının kraliçesi ve Japon imparator hanedanının anasıdır.
Güneşli bayrağı bin yıldan beri Japon askerleri (samuraylar) ve gemileri çekmişti. 1868′da başlayan Meiji Restorasyonu’ndan sonra bu bayrak milli bayrak olarak itibar gördü.
1999′de kabul edilen Ulusal Bayrak ve Marş Kanunu bayrağın ölçülerini saptadı.