Can Dündar 16 Haziran 1961 tarihinde Ankara'da dünyaya geldi.
İlk ve orta öğrenimini memleketinde tamamlayan Dündar, Ankara Atatürk Lisesi'nde eğitimine devam etti.
Lise mezuniyetinin ardından da Ankara Üniversitesi Siyasal Bilgiler Fakültesi'nde okumaya başladı. Basın Yayın Yüksek Okulu'ndan mezun oldu.
Henüz üniversite öğrencisiyken gazeteciliğe başladı.
Birleşik Krallık'taki London School of Journalism'de eğitim görmeye başlayan Dündar, 1986 senesinde buradaki eğitimini tamamladı.
Aynı sene ODTÜ'de Siyaset Bilimi dalında yüksek lisansını tamamladı.
1989 senesinde 32. Gün programının ekibinde çalıştı. 1993-94 yıllarında Mehmet Ali Birand ile birlikte Çapraz Ateş'i hazırladı.
Kariyeri boyunca çeşitli gazetelerde farklı görevlerde bulunan Dündar, 25 Ekim 2013 tarihinde Cumhuriyet Gazetesi'ne geçti ve burada köşe yazarlığı yapmaya başladı.
8 Şubat 2015 tarihinde de aynı gazetenin Genel Yayın Yönetmenliği'ne getirildi.
29 Mayıs 2015 tarihinde "İşte Erdoğan'ın Yok Dediği Silahlar" başlıklı kamuoyunda MİT TIRLARI olarak bilinen bir haber yayınladı. Aynı gün Can Dündar'a ‘devletin güvenliğine ilişkin bilgileri temin etme, siyasî ve askerî casusluk, gizli kalması gereken bilgileri açıklama, terör örgütünün propagandasını yapma’ suçlarından, İstanbul Cumhuriyet Başsavcılığınca soruşturma başlatıldı.
6 Mayıs 2016 tarihinde gerçekleşen dördüncü duruşma sonucunda Dündar, hükmeti ortadan kaldırma suçlamasından beraat etti. Devletin gizli belgelerini elde edip yayınlamaktan yedi yıl hapis cezası alan Dündar'ın cezası beş yıl 10 aya indirildi.
Temyiz süreci devam eden davada tutuksuz yargılanan Dündar yurt dışına kaçtı. Yurt dışına kaçtıktan sonra, gazetedeki Genel Yayın Yönetmenliği görevini bıraktı.
Yurt dışında Türkiye'yi lekelemek adına her türlü iftira ve yalanla kara propoganda yürüten Dündar, halen yurt dışında yaşamaktadır.