Başbuğ, 'Suçlamalara Karşı Gerçekler' adlı kitabında yargıyı, siyasetçileri ve mensubu olduğu Silahlı Kuvvetler'i eleştirdi. İlker Başbuğ tutuklanıp Silivri Cezaevi'ne götürüldüğü geceyi şöyle yazdı: Terörle Mücadele Şubesi'nden polislerin mutlu olmadıkları yüzlerinden anlaşılıyordu. Başlarında bulunan komiser, adliyenin arka kapısından çıkarak binayı terk edebileceğimizi söyledi. Şiddetle karşı çıktım
Ergenekon davasında "Hükümeti devirmeye teşebbüs" iddiasıyla hakkında müebbet hapis cezasına verilen eski Genelkurmay Başkanı emekli Orgeneral İlker Başbuğ'un, Silivri Cezaevi'nde yazdığı yeni kitabı pazartesi günü okuyucuyla buluşuyor. Kaynak Yayınları'ndan çıkan 'Suçlamalara Karşı Gerçekler' adlı 304 sayfalık kitapta, İlker Başbuğ tutuklanması öncesi, sırası ve sonrasında yaşadıklarını ilk kez anlattı.
"Haksızlıkları ve acıları benimle birlikte yaşayan ve paylaşan aileme... Sevil, Feride ve Murat'a" sözleriyle kitabına başlayan İlker Başbuğ, kitabının önsözünde şunları yazdı;