2000 yılında Rektörlük bünyesinde kurulan Avrupa Birliği Ofisi’nin 2009 yılı itibariyle görevleri yeniden tanımlanmış ve ismi Proje Destek Ofisi olarak değiştirilmiştir.
Araştırmalar Koordinatörlüğü altında faaliyet gösteren Proje Destek Ofisi, ulusal ve uluslararası projelerle ilgilenen iki alt birimden oluşmaktadır. Birimler, araştırma projelerinin proje geliştirme, yazma, başvuru ve yürütme aşamalarında danışmanlık hizmeti vermektedir.