Yılın her dönemi sıcak ve nemli bir iklimi olan Honduras yağışların çokça yaşandığı bir coğrafyadır. Özellikle eylül-şubat ve mayıs-ekim arası dönemin yağışlı geçtiği ülkeye gitmek için en ideal zaman yağışların yaşandığı dönem dışındaki tüm zaman aralıkları olabilir. Özellikle ağustos-kasım arası ile mart-mayıs arası turizm faaliyetlerinin daha yoğun yaşandığı ülkede eğer köpekbalıkları ve balinaları izlemek isterseniz tavsiye edilen dönem ise bu şansınız en yüksek olduğu mart-nisan arasıdır.