Ethan Hunt, uluslararası bir terörist örgütün eline geçen ölümcül bir virüsle mücadele etmek üzere göreve çağrılır. Dünya çapında bir felaketi önlemek ve virüsü ele geçirmek amacıyla Hunt, güvenilir bir ekip oluşturur. Ancak, karşısında eski bir IMF ajanı olan Sean Ambrose’u bulur. Ambrose, virüsü ele geçirerek dünya genelinde bir krize neden olmayı planlamaktadır. Hunt’ın görevini daha da zorlaştıran bir diğer faktör ise Ambrose’un çekici ve tehlikeli müttefiki Nyah Nordoff-Hall ile karmaşık bir ilişki içinde olma çabasıdır.