Hayvan hücrelerindeki mitokondri ve bitki hücrelerindeki kloroplast nasıl evrimleştikleri tam olarak anlaşılmış değil. Seninde sorunda belirttiğin gibi kendi başına bağımsız tek hücreli canlılar iken hayvan ve bitki hücresine girerek onların parçası oldukları düşünülüyor.
Tüm canlıların mitokondri DNA'ları bir birinin aynısı değil. Hayvan DNA'larındaki birbirine çok yakın. Çekirdeki DNA canlıdan canlıya farklı olsada farklı canlılardaki mitokondri DNA'sı çok benziyor. Yeni doğan bireye anneden geçer (nadirde olsa bazen babadan geçer) o yüzden anne tarafındaki soy ağacını çıkarmada çok işe yarar.