Enfeksiyon; HSV’nin insan genital bölge epitel hücre yüzey reseptörlerine yapışmasıyla başlar.
Deride bir süre üreyen virüs, nöronlar yolu ile dorsal sinir ganglionlarına yerleşir.Primer enfeksiyon dönemi tamamlandıktan sonra Latent olarak (uyuklama dönemi)sinir ganglionlarında uzun yıllar kalabilme özelliği gösterirler. Belli aralıklarla ganglionlardan tekrar genital bölge derisine gelerek, nüks genital herpes ataklarına yol açarlar.