İnuzuka Shino, İnukawa Sousuke ve Hamaji'nin köyü olan Ootsuka Köyü; bir virüsün görüldüğü herşeyin yok edilmesi gerektiği yanılgısıyla yakılır. Alevler tarafından sarılmış ve ölümün kıyısında oldukları anda, elinde kılıç tutan yabancı bir adam üçüne yaklaşır. Onlara eğer yaşamak istiyorlarsa bir seçim yapmaları gerektiğini söyler. O gece, çocukların hayatını tümüyle değiştirir. 5 yıl sonra, Ootsuka Köyü'nün yakınlarında bir köyde üçü birlikte İmparatorluk Kilisesi'nin gözet
imi altındadırlar. Hepsi de iyi ve düzgün bir durumdadırlar ta ki "Kilise" şeytani kılıç Murasame'yi geri almaya çalışana kadar. Murasame'yi geri alabilmek için, Hamaji'yi kaçırarak, vücudunda Murasame'yi barındıran Shino'yu ve bir köpeğe dönüşebilme yeteneği olan Sousuke'yi tuzağa düşürmeye çalışırlar. Shino ve Sousuke, sevgili kız kardeşlerini İmparatorluk Başkenti'ndeki kilisenin elinden kurtarabilmek için aralarındaki farklılıkları bir kenara koymak zorundadırlar; ve bu da zor bir maceranın başlangıcıdır.