Biyoteknoloji alanında, biyoloji, biyokimya, mikrobiyoloji ve proses mühendisliği alanlarındaki uzmanlık bilgileri belirli maddeleri yeni üretim yöntemleri ile üretmek için kullanılır; örn. biyoreaktörlerde mikroorganizmalar yardımıyla. Mekanik bir madde ayrıştırma yöntemi örneğin, hücre parçalamasıdır. Burada proteinler, amino asitler ve enzimler gibi biyolojik açıdan aktif hücreler arası birleşimler bir mikroorganizmanın hücre çeperinin içinden geçirilerek tecrit edilir ve ayrıştırılır. Karıştırmalı bilyeli değirmenler zarar vermeyen hücre parçalaması için özellikle uygundur.