Karın ağrısının birçok farklı sebebi olabilir Bir organın (örneğin, apandisit, divertikülit, kolit) iltihaplanması, bir organın gerilmesi veya şişmesi (örneğin bağırsağın tıkanması, safra kanalının safra taşı tarafından tıkanması, karaciğerin hepatitle şişmesi) veya bir organa kan akışının kesilmesi (örneğin, iskemik kolit) gibi sebepler en sık görülenleridir.
Karın sağ üst bölümünde olan ağrılardan karaciğer, safra kesesi ve yollarının hastalıkları ve ülser sorunları sorumlu olabilir. Karın sol üst bölümünde olan ağrılarının sebebi dalak, pankreas, ve karın şah damarının (aorta) hastalıkları olabilir. Göbeğin üst bölümünde olan ağrılarda yemek borusu, mide ve on iki parmak barsağının, gastrit, ülser ve reflü gibi hastalıkları akla gelmelidir. Karın sol alt bölümünde olan ağrılarda, kalın bağırsak iltihapları, yumurtalık sorunları, karın şah damarının hastalıkları, idrar sorunları, dış gebelik sorunu ve apandisit problemi olabilir.
Karın sağ alt bölümünde olan ağrılarda apandisit, idrar sorunları, dış gebelik sorunu, yumurtalık sorunları, fıtık boğulması, safra kesesi ve yolları sorunları düşünülmelidir.