Istiklal Mahkemeleri Millî Mücadele yıllarında (Ekim 1920) özel bir kanunla kurulmuş olan mahkemeler. Büyük Millet Meclisi üyesi olan üç milletvekilinden kurulu İstiklâl Mahkemeleri, Büyük Millet Meclisi adına hüküm verme yetkisine sahipti ve verilen hüküm, idam da olsa, hiç bir yere sorulmadan, derhal yerine getirilirdi. İlk İstiklâl Mahkemeleri üç yıl süre ile devam etmiştir. Kurtuluş Savaşının devam ettiği yıllarda, vatanın savunma gücünü sarsan her türlü dâvaya bakılmış ve hükümler verilmiştir. Bu devredeki İstiklâl Mahkemeleri, yurdun çeşitli bölgelerinde kurulmuştu. Bir süre sonra,İstanbul'da yayınlanan bazı gazetelerin hilâfeti savunma yollu yazılarından dolayı İstanbul'da tekrar kurulmuş, yalnız bu konu ile ilgilenmiştir. Bundan sonra, 1925 yılı başlarında Şeyh Sait ayaklanması üzerine biri Diyarbakır'da öbürü Ankara'da olmak üzere iki İstiklâl Mahkemesi kurulmuştur. En son istiklal mahkemesi de büyük Atatürk'e İzmir de yapılacak suikastın haber alınması üzerine İzmirde toplanmıştır.