Güneydoğu Asya'da yer alan Endonezya, dünyanın en büyük takımada ülkelerinden biridir. Ülke, 0.735 milyon mil kareden oluşan bir birleşik alanı kapsayan 13.000'den fazla adadan oluşuyor. Bir ada ülkesi olarak tanınmasına rağmen, Endonezya, 1.924 mil uzunluğunda bir kara sınırına sahiptir. Ülke, kara sınırını üç Doğu Timor (157 mil), Papua Yeni Gine (512 mil) ve Malezya (1, 255 mil) ile paylaşıyor. Endonezya ayrıca Hindistan, Avustralya, Tayland, Vietnam, Palau, Singapur ve Filipinler ile paylaştığı uzun bir deniz sınırına sahiptir.
Papua Yeni Gine
Endonezya ve Papua Yeni Gine toprak sınırını paylaşıyor. İki ülke arasındaki sınır Yeni Gine adasını kesiyor ve 510 mil uzunluğunda. Sınır düz bir çizgiyi takip ediyor ve adanın kuzeyinden güneye doğru ilerliyor. Sınır, Pasifik kıyılarından başlıyor ve Arafura Denizi'nde sona erene kadar güneye gidiyor. Endonezya'nın Batı Papua ve Papua eyaletleri sınır boyunca bulunur. Uluslararası sınır ilk olarak iki millet 19. Yüzyılda İngiliz ve Hollandalıların sömürge yönetimi altındayken belirlendi.
İki ülke, 1979'da bir antlaşma imzaladıktan sonra çözdükleri uzun yıllardır bölgesel anlaşmazlıklara girdiler. Endonezya savunma kuvvetleri, Papua Yeni Gine'nin zincirine birkaç kez sınır ötesi saldırılar düzenlediler. Bununla birlikte, her iki ülke de güvenli bir sınırın bulunmasının iki komşu ülkenin karşılıklı ekonomik yararı için önemli olduğu konusunda hemfikirdir. Papua Yeni Gine-Endonezya sınırındaki en yoğun sınır kapıları arasında Wutung'daki sınır kapısı. Sınır geçişleri, Papua Yeni Gine'den binlerce kişi tarafından Endonezya'daki Bhatas pazarlarında bulunan ucuz eşyalara erişmek için kullanılıyor.
Sınır, sınır ötesi harekâtın çoğunlukla hükümet yetkilileri tarafından düzenlenmemesi nedeniyle gözenekli. Sınır kontrollerinin uygun olmaması, sınırın karşı taraflarında bulunan kabile köylerinin birbirine bağlanmasına yardımcı olurken, bu aynı zamanda her iki ülkeyi de güvenlik ihlallerine maruz bırakıyor. Sorun, ayrılıkçı bir hareketin varlığıyla daha da ağırlaşıyor. Gözenekli sınır, yasadışı kayıt sahiplerinin Yeni Gine'deki orman örtüsünü ağır şekilde etkileyen kereste kaçakçılığı için sınır kontrollerinin olmamasından yararlandığını iddia eden muhafazakârların baş ağrısı olmuştur.
Doğu Timor
Endonezya, Timor adasında Doğu Timor ile kara sınırını paylaşıyor. İki ülke arasındaki sınır, Endonezya'nın 157 mil uzunluğa sahip başka bir ülkeyle paylaştığı en kısa toprak sınırı. Uluslararası sınır ilk kez 1915'te Timor adasında iddiada bulunan Hollandalı ve Portekizliler tarafından tanımlandı. Endonezya, Hollanda'dan bağımsızlığını kazandıktan sonra sınırı koruyacak. Ne var ki sınır, 1970'lerde Portekiz'den bağımsızlık için mücadele ederken Doğu Timor'da iki siyasi gruba çalan kanlı iç savaşa tanık oldu.
Malezya
Endonezya'nın toprak sınırını paylaştığı bir diğer ülke ise Malezya. İki ülkeyi sınırlayan uluslararası sınır Borneo adasındadır. Tanjung Datu'dan başlayarak, sınır Sebatik Körfezi'nde sona eren 1.255 mil uzunluğundadır. Sınır, Endonezya, Batı, Kuzey ve Doğu Kalimantan'ın üç eyaletine dokunuyor. Malezya'da, sınır iki Sarawak ve Sabah devletine dokunuyor.
Malezya ve Endonezya'yı sınırlayan sınır ilk olarak 1891'de iki ülkenin sırasıyla Hollanda ve İngiliz sömürgesi olduğu durumlarda belirlendi. Sınır, 20 Haziran 1891'de Londra'da imzalanan Sınır Sözleşmesinde tanımlanmıştır. İki sömürge gücü daha sonra 20. Yüzyılın başlarında sınırın ince ayarını yapmayı kabul edecekti. Hem Malezya hem de Endonezya, iki ülkenin bağımsızlık kazanmasından sonra sömürgeci güçlerin belirlediği sınırı koruyacak. Ancak iki ülke daha sonra uluslararası sınırın sınırlandırılması konusundaki bölgesel anlaşmazlıklara katılacak. Endonezya ve Malezya nihayet 1975’de başlayan ve 2000’de sona eren Kasım 1973’te sınır konusunda ortak bir hükümetlerarası anket yürütmeyi kabul etti.
Sınır boyunca çok sayıda sınır kapısı vardır. Sınırda, sınır yetkililerinin sınır ötesi hareketi kontrol ettiği sadece üç resmi sınır kapısı bulunuyor. Bu resmi sınır geçişleri Badau-Lubok Antu geçişi, Aruk-Biawak geçişi ve Entikong-Tebedu geçişidir. Bununla birlikte, bu resmi sınır geçişleri olmasına rağmen, sınır gözenekli ve her gün binlerce yasa dışı geçişi yaşıyor. Sınırdaki bazı noktalar, resmi olmayan sınır geçişleri olarak kabul ettikleri çok sayıda yasadışı geçişi yaşamaktadır.
Deniz Sınırları
Endonezya ile toprak sınırını paylaşmanın yanı sıra Malezya, komşu ülkesi ile uzun bir deniz sınırını da paylaşıyor. İki ülkenin Güney Çin Denizi, Singapur Boğazı, Malacca ve Ünlüler Denizi'nde deniz sınırı var. Deniz sınırında, komşu ülkeler arasındaki sınır ötesi hareketi kolaylaştıran 20'den fazla resmi deniz geçidi bulunmaktadır. Deniz sınırı, 20. Yüzyılda birçok uluslararası anlaşmanın imzalanmasından sonra kuruldu. Bununla birlikte, sadece Güney Çin Denizi'ndeki iki ülkeyi sınırlayan sınır her iki ülke tarafından tanımlanmış ve kabul edilmiştir. Sonuç olarak, özellikle iki ülkenin Ambalat Bloku ile Sipadan ve Ligitan adaları üzerinde hak iddia ettiği Celebes Sea'de bölgesel anlaşmazlıklar var.
Endonezya'nın deniz sınırını paylaştığı ülkeler arasında Vietnam var. Deniz sınırı, iki ülkenin Güney Çin Denizi'nde sahip olduğu toprak iddialarını sınırlandırıyor. Sınır, iki ülke arasında 2003 yılında Hanoi'de imzalanan bir anlaşmayla tanımlandı. Anlaşmaya göre, sınır (kıta sahanlığı sınırı olarak bilinir), iki nokta arasında bulunan hayali bir çizgi olarak tanımlandı.