Mikroskop Sistemleri birçok Gelişmiş Teşhis sistemi ve uygulaması için gereklidir. Her uygulama farklı türde bir mikroskop gerektirebilir; en yaygın olanları Stereo ve Ters Mikroskoplardır. Stereo Mikroskoplar, inceleme için gelen ışık aydınlatmasını kullanan optik mikroskoplardır. Stereo Mikroskoplar, üst düzey modellerde yakınlaştırma özelliği veya değiştirilebilir objektifler gibi özelliklerin yanı sıra çok çeşitli büyütme seçenekleri sunar. Ters Mikroskoplar basitçe objektifi ve sensör konumunu numunenin altına çevirir ve hücresel analiz, kuyucuk plakası muayenesi veya kritik özelliklerin ve hücrelerin kuyunun dibinde bulunduğu petri kabı muayenesi için önemlidir. Ters Mikroskoplar, tipik olarak daldırma ortamının neden olduğu küresel ve renk sapmalarının miktarını azaltmak amacıyla alttan en iyi şekilde görüntülenen numuneler için faydalıdır. Mikroskop Sistemleri, insan gözüyle basit veya kolay bir şekilde çözülemeyen küçük özelliklerin ve kusurların analizi için idealdir.
Edmund Optics, aralarında Mitutoyo ve Olympus'un da bulunduğu sektörün önde gelen üreticilerinin Stereo Mikroskoplarını ve Ters Mikroskoplarını sunmaktadır. Mitutoyo FS70 İnceleme Mikroskobu, Mitutoyo Infinity Düzeltilmiş Objektiflerle uyumludur. Olympus Stereo Mikroskoplar, çeşitli uygulama ve sistem alanları için çeşitli montaj konfigürasyonları sunar. Edmund Optics ayrıca, görüntü kalitesine müdahale eden titreşimleri en aza indiren kameralar veya titreşim izolasyon masaları dahil olmak üzere çeşitli Stereo Mikroskop aksesuarları da sunmaktadır.