Milwaukee'nin sekiz kilometre güneyinde yer alan General Mitchell Uluslararası Havaalanı (MKE), Chicago'nun kuzey banliyölerine yakınlığından dolayı genelde Chicago'nun üçüncü havaalanı olarak görülür. 2014'de neredeyse 6.6 milyon yolcuya hizmet veren havaalanı, Southwest Airlines'ın küçük merkezidir. MKE'ye uçan diğer büyük taşıyıcılara American Airlines, Delta Air Lines, Frontier Airlines ve United Express dahildir. Yolcular Milwuakee'den Amerika'nın birçok noktası ile Meksika, Kanada ve Karayipler'e aktarmasız uçabilirler. Wisconsin'in en büyük havaalanı olan General Mitchell Uluslararası Havaalanı'nın beş pisti, bir helikopter pisti ve 48 kapılı bir terminali vardır.