MDDÜ, Fakültelerinin tümüne ya da bazılarına hizmet eden 10 ana akademik Bölüme sahiptir. Bölümlerin kısa tanıtımları şu şekildedir:
- İkinci Yabancı Dil Bölümü, Fransızca ve Almanca Fakülteleri öğrencilerine İngilizce öğretimi verirken İngilizce Fakültesi öğrencilerine Fransızca, Almanca ve İspanyolca öğretimi vermektedir.
- Yabancı Dil Öğretim Bölümü, eğitim veren öğretmenlere gereken Yabancı Dil öğretim yöntemleri konusunda eğitim vermektedir.
- Hümaniter ve Sosyoekonomik Bilimler Bölümünde, lisans, yüksek lisans ve doktora öğrencilerine müfredat gereği Tarih, Bölge Çalışmaları, Felsefe ve Lojik dersleri verilmektedir.
- Psikoloji ve Pedagojik Antropoloji Bölümü, Öğretmenlik ve Psikoloji okuyan öğrencilerin ihtiyaçlarını karşılamaktadır.
- Üniversitenin en eski bölümlerinden biri olan Edebiyat Bölümünde, dil alanında ihtisas yapan herkese gerekli dersler verilmektedir.
- Rusça Bölümü, öğrencilerin ana dili olan Rusça’yı ileri derecede bilmelerini sağladığı gibi dili belirleyen temel kuralları daha iyi anlamalarına olanak sağlamaktadır.
- Klasik Filoloji Bölümünde, birçok Avrupa dilinin temelini oluşturan Latince öğretilmektedir.
- Genel ve Karşılaştırmalı Dil Bilimi Bölümü, Rusya Bilimler Akademisi Dil Bilimi Enstitüsü ile koordinasyon halinde çalışarak dillerin temel özelliklerini irdeler.
- Beden Eğitimi Bölümü, Üniversite öğrencilerinin dayanıklı, atletik ve zinde olmalarına katkıda bulunur.