Aslında pek fark yok. Agnostikler Tanrı'nın henüz bilinmediğini ya da asla bilinemeyeceğini söyler. Yani başka bir değişle Tanrı'nın varlığa bir kanıt olmadığını ya da olamayacağını.
Negatif Ateistler de Tanrı'nın varlığına dair bir kanıt olmadığını söylerler ancak Tanrı'nın varlığına yönelik ikna edici bir kanıt olmadığı için Tanrı'ya inanmazlar. Tıpkı gökteki bir çaydanlığın bizi yarattığına yönelik kanıt olmadığı için ona inanmamanız gibi.
Birbirine oldukça yakın hatta neredeyse çoğu konuda aynı şeyi söyledikleri için kimi zaman negatif ateistleri "agnostik ateist" olarak da sınıflandırabiliyorlar. Hatta agnostikleri "negatif ateist" olarak sayan kategorizasyonlar da var.
Bana kalırsa Agnostisizm, sadece "Tanrı şu an bilinmiyor ya da bilinemiyor." der ve başka bir konuda yorum yapmaz. Bundan yola çıkarak "Kanıt gelene kadar ya da kant olamayacağı için inanmıyorum." deyip negatif ateist ya da agnostik ateist mi olursunuz, "Tanrı'ya yönelik onu bilmemizi sağlayan bir kanıt olmasa da inanıyorum." deyip agnostik teist mi olursunuz ya da "Tanrı"ya inanıp inanmama konusunda yorum yapmayıp "Bilmiyorum, Tanrı var, yok, inanıyorum, inanmıyorum gibi yorum yapmayacağım." deyip sadece "Agnostik" mi kalırsınız o size kalmış. Hatta Agnostik olup kimi konularda negatif ateist olup kimi konularda sadece agnostik olabilirsiniz. Felsefi pozisyonlar çok geniş bir yelpazede olduğu için kendi görüşünüzü birkaç kelime grubu ile ifade etmek çoğu zaman zorlayıcı olabiliyor da sizin görüşünüzü tam olarak yansıtmayabiliyor.