

Eugene Kaspersky’nin matematiğe olan sevgisi onun "teknik" geleceğini belirledi. Lisede hobilerinden biri matematik dergilerinde yayınlanan problemleri çözmekti. Lisendeki son yıllarında Moskova Fizik ve Teknoloji Enstitüsü'nün düzenlediği özel bir programdaki müfredat dışı fizik ve matematik derslerine katıldı. Eugene lisenin son iki yılını yetenekli öğrenciler için Moskova Devlet Üniversitesi'nin düzenlediği ve katkıda bulunduğu fizik ve matematik derslerini alarak geçirdi.
Eugene 1987 yılında Kriptografi, Telekomünikasyon ve Bilgisayar Bilimi Enstitüsü'nden mezun oldu. Burada matematik, kriptografi ve bilgisayar teknolojisi alanlarında eğitim alarak, matematik mühendisliğinden mezun oldu.
Eugene mezun olduktan sonra multidisipliner bir araştırma enstitüsünde çalıştı. Eugene burada, Ekim 1989 yılında bilgisayarında Cascade virüsünü saptadıktan sonra, ilk kez bilgisayar virüslerini incelemeye başladı. Eugene virüsü çözümledi ve bir temizleme yardımcı programı geliştirdi; geliştirdiği böylesi ilk yardımcı program. Kötü amaçlı programları ve onları temizleme modüllerini toplamaya başladı. Bu egzotik koleksiyon daha sonra Kaspersky Anti-Virüs'ün meşhur anti-virüs veritabanının temelini oluşturdu. Bugün bu veritabanı 4 milyondan fazla kaydı kapsıyor ve dünyadaki en eksiksiz anti-virüs veritabanlarından biridir.
1991 yılında Eugene bir grup iş arkadaşıyla Kaspersky Anti-Virüs'ün prototipi olan AVP anti-virüs projesini geliştirdiği KAMI Bilgi Teknolojileri Merkezi'ne katıldı. Projenin uluslararası tanınırlığı, 1994 yılında gerçekten tanınmayan AVP'nin, Hamburg Üniversitesi'nin test laboratuarı tarafından yapılan bir yarışmayı o sırada en popüler anti-virüs programlarından daha yüksek bir virüs saptama oranı göstererek kazanmasıyla oldu.
1997 yılında Eugene ve iş arkadaşları bağımsız bir şirket kurmaya karar vererek Kaspersky Lab'ın kurucuları oldular.
O günden bu yana Eugene şirketin anti-virüs araştırmalarına başkanlık yapmaktadır.
2007 yılında Eugene Kaspersky Lab'ın CEO'su oldu.
Eugene Rusya Federasyonu Devlet Ödülünü kazanmıştır ve Rusya Federasyonu Yurttaşlar Kamarası'nın üyesidir. Eugene 2010 yılında SC Magazine Europe'un Yılın CEO'su ödülünü almıştır.