Bir shinobinin torunu olan Jirou Azuma, hayatı boyunca ninja tekniklerini öğreniyordu. Ama bunun yanında, hayvanlarla konuşabilme yeteneği de var. Bir gün, Ragou adında siyah tuhaf bir kediyi kurtarır. Dünya'nın, mononoke isimli, hem insan hem de hayvan kılığına girebilen ruhlarla dolu olduğunu öğrenir. Ancak Ragou'nun gücünün peşinde olan düşman bir Mononokenin saldırısına uğradıklarında buluşmaları yarım kalır.