Pasifik Okyanusu yanındaki minik bir kasaba olan Sakurada'da yaşayan halkın neredeyse yarısı değişik özel güçlere sahiptir. Bir kedinin zihnine girmekten tutun, dünyayı geçmişteki bir noktaya dönecek şekilde resetlemeye kadar çeşitli güçlerdir bunlar. "İdari Merkez" denen bir grup, bu güçlerin kullanımını gözetlemekte ve kontrol altında tutmaktadır. Asai Kei ve Haruki Misora okullarında Merkez'den gelen görevleri yerine getirmeyi amaç edinen "Houshi" isimli kulüple birlikte çalışıyordur. Misora dünyayı 3 g
ün öncesine resetleyebilir. Yani geçen 3 günde güya gerçekleşmiş tüm olaylar ve hatıralar aslında hiç gerçekleşmemiştir. Kei'nin yeteneği ise geçmişi "hatırlamak"tır. Misora, dünyayı 3 gün öncesine resetleme gücünü kullansa da o 3 günde olanlar Kei'nin zihninde kalmaktadır. Bu ikili güçlerini birleştirerek Kanrikyou tarafından verilen görevleri çözeceklerdir.