Sturtevant'ın Morgan altındaki ilk başarısı, farklı genler arasındaki göreceli mesafeyi ölçmekteydi, ki bu, ilk olarak, hangi özelliklerin “çarpıldığı” frekansını hesaplayarak başarmayı başardı. Bu ilk gen haritalaması, en sık meydana gelen özelliklerin, genlere bağlı olduğunu kanıtladı. Bu birbirine en yakın olanıydı. Sturtevant doktora derecesini aldı. 1914 yılında Columbia'dan mezun oldu.
Halen Columbia'da iken, Sturtevant, bir genin kromozom üzerine yerleştirilmesinin etkisini belirlediğini kanıtlayan “pozisyon etkisi” ni de keşfetti. Tekniklerini mükemmelleştiren Sturtevant ve meslektaşları nihayetinde Drosophila'nın dört kromozomunun üçünü haritalandırabildi, ancak sonuncusu inanılmaz derecede küçük bir sır olarak kaldı. 1951'de, Sturtevant'ın kendisini haritalandırarak başka bir başarısı vardı.
1928'den itibaren, Sturtevant, Morgan'ın bir biyolojik bilimler bölümü kurduğu Pasadena'daki California Teknoloji Enstitüsü'ndeydi. Sturtevant, üniversitenin ilk genetik profesörü ve 1965'te bugün hala önemli olan bir metin olan Genetik Tarihi'ni yayınladı. Birkaç Avrupa ve Amerikan üniversitesinde misafir öğretim üyesi olarak kısa dönemler dışında, kariyerinin geri kalanı için Caltech'te kaldı ve başarıları için 1968'de Ulusal Madalya Ödülü'nü aldı.