İdrar bulanıklığının en sık nedeni idrar yolu enfeksiyonudur. Bulanık idrarın sebebi idrar yolu enfeksiyonu ise idrar tahlilinde lökosit ve/veya bakteri varlığı da sıklıkla birlikte görülmektedir. Ayrıca idrar yolu enfeksiyonlarında kan ile birlikte bulanık idrarda olabilir. Böbrek taşı da bir diğer bulanık idrar sebebi olabilir.
İdrar renginin bulanık olmasının bir diğer nedeni de idrarda protein kaçağının olması olabilir. Proteinüri idrarda protein olması durumuna verilen isimdir. Proteinüri pek çok hastalık habercisi olabilir. Şeker hastalığı (diyabet) veya yüksek tansiyonun neden olduğu böbrek hasarına bağlı proteinüri ilk bulgu olabilir.
Böbreğin içindeki glomerüllerin iltihabı anlamına gelen glomerülonefrit hastalığında da bulanık idrar şikayeti olabilir. Bu durumda da idrarda protein kaçağı (proteinüri) olabilir.
Çok su kaybedilen dehidratasyon durumlarında idrar rengi koyulaşabilir.