Genital kondilom bulaşını ve tekrarlarını azaltmanın en etkili yolu birden fazla sayıda partner ile birlikte olmamak, sık partner değiştirmemek ve güvenli partner seçmektir. Prezervatif kullanımı bulaşmayı en etkili şekilde önlese de HPV bulaşmasına karşı tam koruma sağlamaz, çünkü siğiller kondomun kapladığı alan dışında da bulunabildiğinden, etkisiz kalabilir. Buna rağmen pezervatif kullanılmalıdır çünkü HPV ile birlikte diğer cinsel ilişki ile geçen hastalıklar da olabileceği için korunma önemlidir. Diğer bir yöntem HPV aşısı yaptırmaktır.