Görgü tanıklarının ifadelerine göre, birkaç kişi penceresinden içeri molotof kokteyli atarak caminin yanmasına neden oldu.
Danimarka'da minareli cami olmamasından dolayı Danimarka'da yaşayan Türkler ve diğer Müslümanlar, Cuma namazını kılmak için yarım saat mesafede olan Malmö'ye gelerek hem namazlarını kılıyor hem de birbirleriyle görüşüyordu. Çok kalabalık bir cemaate ev sahipliği yapan Malmö Camii, 2003 Nisan ayında da bilinmeyen kişiler tarafından ateşe verilmişti.