Caminin önündeki son cemaat yeri birbirlerine yuvarlak kemerlerle bağlanan altı sütunun taşıdığı beş kubbe ile örtülüdür. Son cemaat yerindeki 1573 tarihli Arapça bir kitabede; “Bu mescid-i şerifi ve camii mürifi uluların kahramanı; Arap Acem ve Rum’un hakanı Süleyman Han oğlu Sultan Selim’in Allah hilafetini kıyamet gününe kadar muhalefet etsin. Saltanat günlerinde büyük emir Murad Paşa Allah istediğini kolay kılsın. Allah bunu kendisinden hüsnü kabul ile kabul buyursun. 981 senesinde yapıldı” yazılıdır.
Caminin Efsanesi;
Murat Paşa Camiinin inşaatı esnasında, Murat Paşa önceki camiyi yaptıran kişiyi rüyasında görür ve onunda, sevabım devam ettirmek amacıyla eski caminin minaresini yeni camide kullanacağına söz verir. Ancak verdiği sözü unutur. Bir gün Murat Paşa’nın karşısına bir adam dikilir;
- “Ahmet’e verdiğin sözü tut” der.
Paşa karşısındakinin Hızır olduğunu anlayarak,
- "Peki, benim bu işten ne kazancım olacak” diye sorduğunda, Hızır Aleyhi selam;
- “Camin yıkılıncaya kadar beş vakit namazdan birini caminde kılacağım” diye söz verir.
Bu efsaneye göre 5 vakit namazım bu camide kılan kişinin vakitlerden birinde Hızır Aleyhi selam ile karşılaşacağına inanılır.