PubMed - PubMed
|Temas etmek|
|Araştırma Merkezi||Amerika Birleşik Devletleri Ulusal Tıp Kütüphanesi (NLM)|
|Yayın tarihi||Ocak 1996|
|Erişim|
|İnternet sitesi||pubmed


PubMed , öncelikle yaşam bilimleri ve biyomedikal konulardaki MEDLINE referans ve özet veritabanına erişen ücretsiz bir arama motorudur . Birleşik Devletler Ulusal Tıp Kütüphanesi de (NLM) Ulusal Sağlık Enstitüleri bir parçası olarak veritabanını korumak Entrez sisteminde bilgi alma .
1971'den 1997'ye kadar, MEDLINE veri tabanına çevrimiçi erişim, öncelikle üniversite kütüphaneleri gibi kurumsal tesisler aracılığıyla olmuştur . İlk olarak Ocak 1996'da piyasaya sürülen PubMed, özel, ücretsiz, ev ve ofis tabanlı MEDLINE arama çağını başlattı. PubMed sistemi, Haziran 1997'den itibaren halka ücretsiz olarak sunuldu.
İçerik
MEDLINE'a ek olarak, PubMed şunlara erişim sağlar:
- Index Medicus'un basılı versiyonundan 1951 ve öncesine kadar eski referanslar
- Science , BMJ ve Annals of Surgery gibi Index Medicus ve MEDLINE'da indekslenmeden önce bazı dergilere referanslar
- Tıbbi Konu Başlıkları (MeSH) ile indekslenmeden ve MEDLINE'a eklenmeden önce bir makalenin kayıtlarına çok yeni girişler
- NLM kayıtlarının tam metni ve diğer alt kümeleri bulunan bir kitap koleksiyonu
- PMC alıntıları
- NCBI Kitaplık
MEDLINE'da indekslenen ve PubMed aracılığıyla erişilebilen dergiler hakkında bilgiler NLM Kataloğu'nda bulunur.
27 Ocak 2020 tarihi itibariyle PubMed'in 1966 yılına, seçici olarak 1865 yılına ve çok seçici olarak 1809 yılına ait 30 milyondan fazla alıntı ve özeti bulunmaktadır. Aynı tarih itibariyle PubMed'in 20 milyon kaydı özetleriyle birlikte listelenmiştir ve 21,5 milyon kaydın tam metin sürümlerine bağlantıları vardır (bunun 7,5 milyon makalesi mevcuttur, tam metin ücretsiz). Son 10 yılda (31 Aralık 2019'da sona eren), her yıl ortalama yaklaşık 1 milyon yeni kayıt eklendi. PubMed'deki kayıtların yaklaşık %12'si, 1950'lerde %6'dan 2016'da %16'ya yükselen kanserle ilgili girdilere karşılık gelir. Kayıtların diğer önemli bir kısmı “kimya” (%8,69), “terapi” (8,39) ile ilgilidir. %) ve "enfeksiyon" (%5).
2016'da NLM, dizin oluşturma sistemini, yayıncıların PubMed dizinli makalelerdeki yazım hatalarını ve hataları doğrudan düzeltebilmesi için değiştirdi.
PubMed'in yırtıcı dergilerde yayınlanan bazı makaleleri içerdiği bildirildi. MEDLINE ve PubMed'in veritabanına dahil edilecek dergilerin seçimine ilişkin politikaları biraz farklıdır. PubMed Central'da dergilerin indekslenmesine yönelik kriterler ve prosedürlerdeki zayıflıklar, predatör dergilerden gelen yayınların PubMed'e sızmasına izin verebilir.
özellikleri
Web sitesi tasarımı
Ekim 2009'da yeni bir PubMed arayüzü kullanıma sunuldu ve bu tür hızlı, Google benzeri arama formülasyonlarının kullanımını teşvik etti; ayrıca 'telgraf' aramaları olarak da tanımlanmıştır. Varsayılan olarak sonuçlar En Son'a göre sıralanır, ancak bu En İyi Eşleşme, Yayın Tarihi, İlk Yazar, Son Yazar, Dergi veya Başlık olarak değiştirilebilir.
PubMed web sitesi tasarımı ve etki alanı Ocak 2020'de güncellendi ve güncellenen ve yeni özelliklerle 15 Mayıs 2020'de varsayılan oldu. Siteyi sıklıkla kullanan birçok araştırmacıdan kritik tepkiler geldi.
El bilgisayarları/mobil cihazlar için PubMed
PubMed/MEDLINE'a, örneğin NLM tarafından oluşturulan "PICO" seçeneği (odaklı klinik sorular için) kullanılarak elde taşınan cihazlar aracılığıyla erişilebilir . Mobil uyumlu, basitleştirilmiş bir PubMed sürümüne erişim sağlayan bir "PubMed Mobile" seçeneği de mevcuttur.
Arama
Standart arama
PubMed'de basit aramalar, bir konunun önemli yönleri PubMed'in arama penceresine girilerek gerçekleştirilebilir.
PubMed bu ilk arama formülasyonunu çevirir ve otomatik olarak alan adlarını, ilgili MeSH (Tıbbi Konu Başlıkları) terimlerini, eşanlamlıları, Boole operatörlerini ve ortaya çıkan terimleri uygun şekilde "iç içe geçirir", özellikle rutin olarak birleştirerek (OR kullanarak) arama formülasyonunu önemli ölçüde geliştirir. operatörü) metin kelimeleri ve MeSH terimleri.
Bir PubMed eğitiminde verilen örnekler, bu otomatik sürecin nasıl çalıştığını gösterir:
Uykuda Yürümenin Nedenleri ("etiyoloji"[Alt başlık] VEYA "etiyoloji"[Tüm Alanlar] VEYA "nedenler"[Tüm Alanlar] VEYA "nedensellik"[MeSH Terimleri] VEYA "nedensellik"[Tüm Alanlar]) VE ("uyurgezerlik" olarak çevrilir. "[MeSH Terimleri] VEYA "uyurgezerlik"[Tüm Alanlar] VEYA ("uyku"[Tüm Alanlar] VE "yürüme"[Tüm Alanlar]) VEYA "uykuda yürüme"[Tüm Alanlar])
Aynı şekilde,
soft Attack Aspirin Prevention ("miyokard enfarktüsü"[MeSH Terimleri] VEYA ("miyokardiyal"[Tüm Alanlar] VE "infarktüs"[Tüm Alanlar]) VEYA "miyokard enfarktüsü"[Tüm Alanlar] VEYA ("kalp"[Tümü] olarak çevrilir. Alanlar] VE "saldırı"[Tüm Alanlar]) VEYA "kalp krizi"[Tüm Alanlar]) VE ("aspirin"[MeSH Terimleri] VEYA "aspirin"[Tüm Alanlar]) VE ("önleme ve kontrol"[Alt Başlık] VEYA ("önleme"[Tüm Alanlar] VE "kontrol"[Tüm Alanlar]) VEYA "önleme ve kontrol"[Tüm Alanlar] VEYA "önleme"[Tüm Alanlar])
Kapsamlı arama
PubMed'de en uygun aramalar için, temel bileşeni olan MEDLINE'ı ve özellikle MEDLINE makalelerini indekslemek için kullanılan MeSH (Tıbbi Konu Başlıkları) kontrollü kelime dağarcığını anlamak gerekir. Ayrıca karmaşık arama stratejileri, alan adlarının (etiketlerin) kullanımı, sınırların ve diğer özelliklerin uygun şekilde kullanılmasını gerektirebilirler; referans kütüphaneciler ve arama uzmanları arama hizmetleri sunar.
PubMed'in arama penceresine yapılan arama, yalnızca net konuların veya henüz bir MeSH başlığı oluşturulmamış yeni müdahalelerin yanı sıra ilaçların ticari markalarının ve özel isimlerin aranması için önerilir. Uygun bir başlık olmadığında veya tanımlayıcı kısmi bir yönü temsil ettiğinde de yararlıdır. Eş anlamlılar sözlüğü MeSH kullanılarak yapılan arama daha doğrudur ve daha az alakasız sonuç verecektir. Ayrıca imla, tekil/çoğul veya kısaltılmış farkların dikkate alınması gereken serbest metin aramasının dezavantajını da ortadan kaldırır. Öte yandan, veri tabanına daha yakın zamanda dahil edilen ve tanımlayıcıları henüz atanmamış makaleler bulunmayacaktır. Bu nedenle, kapsamlı bir aramayı garanti etmek için, kontrollü dil başlıkları ve serbest metin terimlerinin bir kombinasyonu kullanılmalıdır.
Dergi makale parametreleri
Bir dergi makalesi indekslendiğinde, çok sayıda makale parametresi çıkarılır ve yapılandırılmış bilgi olarak saklanır. Bu parametreler şunlardır: Makale Türü (MeSH terimleri, örneğin "Klinik Araştırma"), İkincil tanımlayıcılar (MeSH terimleri), Dil, Derginin Ülkesi veya yayın tarihi (e-yayın tarihi, basılı dergi yayın tarihi).
Yayın Türü: Klinik sorgular/sistematik incelemeler
Yayın türü parametresi , çeşitli klinik araştırma raporları da dahil olmak üzere yayın türüne göre arama yapılmasına olanak tanır .
ikincil kimlik
Temmuz 2005'ten bu yana, MEDLINE makale indeksleme süreci, makale özetinden tanımlayıcıları çıkarır ve bunları İkincil Tanımlayıcı (SI) adlı bir alana koyar. İkincil tanımlayıcı alanı, erişim numaralarını moleküler dizi verilerinin, gen ekspresyonunun veya kimyasal bileşiklerin ve klinik deney kimliklerinin çeşitli veritabanlarına depolamak içindir. Klinik araştırmalar için, PubMed en büyük iki araştırma kaydı için deneme kimliklerini çıkarır: ClinicalTrials.gov (NCT tanımlayıcısı) ve Uluslararası Standart Randomize Kontrollü Deneme Numarası Kaydı (IRCTN tanımlayıcısı).
Ayrıca bakınız
Özellikle ilgili olduğuna karar verilen bir referans işaretlenebilir ve "ilgili makaleler" tanımlanabilir. İlgiliyse, birkaç çalışma seçilebilir ve 'İlgili verileri bul' seçeneği kullanılarak hepsiyle ilgili makaleler (PubMed veya diğer NCBI Entrez veritabanlarından herhangi birinde) oluşturulabilir. İlgili makaleler daha sonra "ilişki" sırasına göre listelenir. Bu ilgili makale listelerini oluşturmak için PubMed, güçlü bir kelime ağırlıklı algoritma kullanarak her bir alıntının başlığından ve özetinden ve ayrıca atanan MeSH başlıklarından kelimeleri karşılaştırır. 'İlgili makaleler' işlevinin o kadar kesin olduğuna karar verildi ki, bir makalenin yazarları tam bir arama yerine kullanılabileceğini önerdi.
MeSH'ye Eşleme
PubMed, otomatik olarak MeSH terimlerine ve alt başlıklarına bağlanır. Örnekler: "ağız kokusu" ile "ağız kokusu", "kalp krizi" ile "miyokard enfarktüsü", "meme kanseri" ile "meme neoplazmaları" arasındaki bağlantılar (ve aramaya dahil edilir). Uygun olduğunda, bu MeSH terimleri otomatik olarak "genişletilir", yani daha spesifik terimleri içerir. "Hemşirelik" gibi terimler otomatik olarak "Hemşirelik [MeSH]" veya "Hemşirelik [Alt Başlık]" ile bağlantılıdır. Bu özelliğe Otomatik Terim Eşleme adı verilir ve varsayılan olarak serbest metin aramada uygulanır, ancak tam ifade aramada (yani arama sorgusunu çift tırnak içine alma) uygulanmaz. Bu özellik, PubMed aramalarını daha hassas hale getirir ve tıbbi terminolojinin çeşitliliğini telafi ederek yanlış negatif (kaçırılan) isabetleri önler.
PubMed, aşağıdaki durumlarda terimin otomatik eşlemesini uygulamaz: alıntılanan ifadeyi yazarak (örn., "böbrek allogrefti"), yıldız işaretiyle kesildiğinde (örn. Kanser [ti]).
NCBI'm
PubMed isteğe bağlı tesisi "My NCBI" (ücretsiz kayıt ile), aşağıdakiler için araçlar sağlar:
- aramaları kaydetme
- arama sonuçlarını filtreleme
- e-posta ile gönderilen otomatik güncellemeleri ayarlama
- PubMed aramasının bir parçası olarak alınan referans setlerini kaydetme
- görüntüleme biçimlerini yapılandırma veya arama terimlerini vurgulama
ve çok çeşitli diğer seçenekler. "NCBI'm" alanına web erişimi olan herhangi bir bilgisayardan erişilebilir. "My NCBI"ın önceki bir sürümüne "PubMed Cubby" adı verildi.
Birbirine bağlamak
LinkOut, tam metin yerel dergi varlıklarını birbirine bağlamak ve kullanıma sunmak için bir NLM tesisidir. Danimarka'daki Aalborg Üniversitesi'nden Seattle'daki ZymoGenetics'e kadar bu NLM tesisine (Mart 2010 itibariyle) yaklaşık 3.200 site (çoğunlukla akademik kurumlar) katılmaktadır . Bu kurumlardaki kullanıcılar PubMed arama sonuçlarında (dergi o kurumda tutuluyorsa) kurumlarının logosunu görür ve tam metnine ulaşabilirler. Bağlantı çıkışı, 2019 Yazında gelen büyük platform güncellemesinden itibaren Dış Araç ile konsolide ediliyor.
PubMed Commons
2016'da PubMed, makale yazarlarının PubMed tarafından indekslenen makaleler hakkında yorum yapmasına izin verir. Bu özellik başlangıçta bir pilot modda (2013'ten beri) test edildi ve 2016'da kalıcı hale getirildi. Şubat 2018'de "kullanım minimum düzeyde kaldığından" PubMed Commons durduruldu.
sorMEDLINE
NLM tarafından geliştirilen, MEDLINE/PubMed için serbest metin, doğal dil sorgulama aracı olan askMEDLINE, el bilgisayarları için de uygundur.
PubMed tanımlayıcısı
Bir PMID (PubMed tanımlayıcısı veya PubMed benzersiz tanımlayıcısı) , ile başlayan ve her PubMed kaydına atanan benzersiz bir tamsayı değeridir
1 . Bir Sayfalar bir aynı değildir Bulunamayan PMCID ( P ub M ed C Entral id free-to-erişimde yayınlanan tüm eserlerin belirleyicisidir entifier) PubMed Central .
Bir yayına PMID veya PMCID atanması, okuyucuya içeriğin türü veya kalitesi hakkında hiçbir şey söylemez. PMIDs atanan editöre mektuplar , editör görüşleri, op-ed sütunlar ve editör seçer dergide yer vermelerini başka parça yanı sıra hakemli makale. Kimlik numarasının varlığı, evrakların dolandırıcılık, yetersizlik veya görevi kötüye kullanma nedeniyle geri alınmadığının da kanıtı değildir . Orijinal makalelerde yapılacak düzeltmelere ilişkin duyuruya bir PMID atanabilir.
PubMed arama penceresine girilen her numara, varsayılan olarak bir PMID gibi değerlendirilir. Bu nedenle, PubMed'deki herhangi bir referans PMID kullanılarak bulunabilir.
Alternatif arayüzler
National Library of Medicine, MEDLINE bilgilerini Embase , Ovid , Dialog , EBSCO , Knowledge Finder ve diğer birçok ticari, ticari olmayan ve akademik sağlayıcı gibi bir dizi özel satıcıya kiralamaktadır . Ekim 2008 itibariyle, 200'den fazlası Amerika Birleşik Devletleri dışındaki sağlayıcılara olmak üzere 500'den fazla lisans verilmişti. MEDLINE verilerini kullanmak için lisanslar ücretsiz olarak mevcut olduğundan, NLM aslında çok çeşitli alternatif arayüzler ve bu seçeneği sunan çok az sayıda büyük, profesyonelce derlenmiş veritabanlarından biri olan PubMed'e üçüncü taraf eklemeleri için ücretsiz bir test alanı sağlar.
Lu, kurulum veya kayıt gerektirmeyen ve dört kategoride gruplandırılmış 28 güncel ve ücretsiz Web tabanlı PubMed sürümünün bir örneğini tanımlar:
- Sıralama arama sonuçları, örneğin: eTBLAST ; MedlineRanker; MiArama;
- Konulara, yazarlara, dergilere vb. göre kümeleme sonuçları, örneğin: Anne O'Tate ; ClusterMed;
- Anlambilim ve görselleştirmenin geliştirilmesi, örneğin: EBIMed; MedEvi.
- Geliştirilmiş arama arayüzü ve erişim deneyimi, örneğin, askMEDLINE BabelMeSH; ve PubCrawler.
Bunların ve diğer alternatiflerin çoğu, esas olarak NLM/PubMed lisansı altında kiralanan PubMed/MEDLINE verilerine dayandığından, "PubMed türevleri" terimi önerilmiştir. Yaklaşık 90 GB orijinal PubMed Veri Kümesi depolamaya gerek kalmadan, herkes eutils-application program arayüzünü kullanarak PubMed uygulamalarını Eric Sayers, PhD tarafından "E-utilities In-Depth: Parameters, Syntax and More" bölümünde açıklandığı gibi yazabilir. PMID numaralarını girdi olarak alan çeşitli alıntı formatı üreteçleri, eutils-uygulama programı arayüzünü kullanan web uygulamalarına örnektir. Örnek web sayfaları Citation Generator - Mick Schroeder , Pubmed Citation Generator - Haftanın Ultrasonu , PMID2cite ve Cite this for me'yi içerir .
PubMed'in veri madenciliği
PubMed'de veri madenciliği yapmak için alternatif yöntemler Matlab , Python veya R gibi programlama ortamlarını kullanır . Bu durumlarda, PubMed'in sorguları kod satırları olarak yazılır ve PubMed'e iletilir ve ardından yanıt doğrudan programlama ortamında işlenir. Kod, hastalık, yıl, organlar vb. gibi farklı anahtar kelimelerle sistematik olarak sorgulamak için otomatikleştirilebilir. Yakın tarihli bir yayın (2017), PubMed'deki kanserle ilgili girişlerin oranının 1950'lerde %6'dan 2016'da %16'ya yükseldiğini buldu. .
PubMed tarafından erişilebilen veriler, MEDOC gibi resmi olmayan bir araç kullanılarak yerel olarak yansıtılabilir.
Milyonlarca PubMed kaydı , Unpaywall gibi açık erişimle ilgili çeşitli açık veri kümelerini güçlendirir . Unpaywall Journals gibi veri analiz araçları , kütüphaneler tarafından büyük çaplı iptallere yardımcı olmak için kullanılır : kütüphaneler, PubMed Central gibi açık arşivler aracılığıyla anında açık erişim tarafından halihazırda sunulan materyallerin aboneliklerinden kaçınabilir .
Ayrıca bakınız
- PubMed Merkezi
- Avrupa PubMed Merkez
- PubMed Orta Kanada
- JournalReview.org
- Akademik veritabanlarının ve arama motorlarının listesi
Referanslar


Vikiveri şu özelliklere sahiptir:

