Sovyetler Birliği’nin çöküşünün ardından 1991 Ağustos’unda bağımsızlığını ilan eden Moldova bir yıl sonra Birleşmiş Milletler tarafından da tanınmıştır. Paleoloitik dönemden kalma izlere rastlanan ülke topraklarında bugüne dek Gotlar, Hunlar, Avarlar, Macarlar, Kumanlar, Tatarlar ve Moğollar hüküm sürmüştür.
19. yüzyılda Osmanlı İmparatorluğu, Romanya ve Rusya arasında bölünen ülke Rus Devrimi sonrası Romanya’ya katılmıştır. 1924 senesinde Moskova yörüngesine giren ülke Sovyetlerin kontrolünde kalmıştır. 1980’lerle beraber bağımsızlık mücadelesine başlayan ülke pek çok kanlı mücadele atlatmıştır. Ülkenin doğusunda kalan Transdinyester ekonomik nedenlerle Moldova’dan ayrılıp bağımsızlığını ilan etme mücadelesindedir. Her ne kadar özerkliğini ilan etmiş olsa da Birleşmiş Milletler henüz Transdinyester’i tanımamıştır.