11.13: lncRNA - Uzun Kodlamayan RNA'lar
İnsanlarda, genomun %80'inden fazlası kopyalanır. Bununla birlikte, genomun sadece %2'si proteinleri kodlar. Kalan kısım, diğer tiplerin yanı sıra ribozomal RNA'lar, transfer RNA'ları, telomeraz RNA'ları ve düzenleyici RNA'ları içeren kodlamayan RNa'lar üretir. Düzenleyici kodlamayan RNA'ların çok sayıda uzunluğuna bağlı olarak iki gruba ayrılmıştır – küçük kodlamayan RNA'lar, mikroRNA gibi, daha az olan 200 nükleotid uzunluğu, ve uzun kodlamayan RNA (lncRNA) daha fazla olan 200 nükleotid uzunluğu. Lncrna'lar kromatin modifikasyonunda, gen ekspresyonunun düzenlenmesinde, hücre farklılaşmasında ve immün yanıtta hayati bir rol oynar. Kodlayıcı olmayan RNA olarak adlandırılsa da, bazı lncRNA'lar kısa peptitler üretebilir. LncRNA'lar birçok dokuda bulunur, ancak özellikle beyinde ve merkezi sinir sisteminin diğer kısımlarında bol miktarda bulunur.
lncRNA genomik konumlarına göre sınıflandırılabilir. Bazı lncRNA'lar iki gen arasındaki bölgelerden sentezlenir ve büyük intergenik kodlamayan RNA'lar (lincRNA'lar) olarak bilinir. LncRNA'lar ayrıca genler içindeki bölgelerden üretilir ve sense DNA ipliğinden sentezlenen sense lncRNA'yı ve anti-sense DNA ipliğinden üretilen antisens lncRNA'yı içerir. İntronik lncRNA'lar, bir gende bulunan intronlardan üretilen başka bir lncRNA sınıfıdır.
lncRNA'lar ayrıca işlevlerine göre sınıflandırılabilir. Kılavuz lncRNA, kromatin modifikasyonu ve transkripsiyonel düzenleme gibi farklı işlevleri yerine getirmek için spesifik protein komplekslerini hedef genlerine yönlendirir. Kılavuz lncRNA'nın iyi çalışılmış bir örneği, transkripsiyonel bir baskılayıcı kompleks olan Polycomb baskılayıcı kompleks 2'yi HOXD lokusuna yönlendiren hox transkript antisens intergenik RNA'dır (HOTAIR) . Bazı lncRNA'lar, telomeraz kompleksinin bağlanması için bir iskele görevi gören telomeraz RNA bileşeninde (TERC) görüldüğü gibi spesifik protein bağlanması için bir iskele görevi görür. lncRNA ayrıca moleküler bir sünger veya yem olarak hareket edebilir ve proteinler ve mikroRNA gibi düzenleyici molekülleri hedef genlerinden ayırabilir. Örneğin, lncRNA PANDA, p53 aracılı apoptozu önlemek için nükleer transkripsiyon faktörü Y alt birimi alfa'yı hedefleyen genlerden ayırır.
lncRNA'lar kanser gelişiminde önemli bir rol oynar ve tümör baskılayıcılar veya promotörler olarak işlev görebilir. Birkaç lncRN'nın anormal ekspresyonu tümöre özgü bir şekilde gözlenmiştir. Örneğin, & # 160; MALAT1 ve XIST lncRNA'lar beyin kanseri ile ilişkiliyken, hottip ve HOTAIR lncRNA'lar akciğer kanseri ile ilişkilidir. Bu kanserle ilişkili lncRNA'lar, kanser tedavisi için yeni terapötik hedeflerin yanı sıra tanısal bir biyobelirteç olarak da kullanılabilir.,