Guinea Pig 3: He Never Dies, kendini öldürmeye çalışan ancak başaramayan bir adamın yaşadığı acı dolu deneyimleri anlatan bir korku filmidir. Film, izleyiciyi rahatsız eden ve şoke eden kanlı sahnelerle doludur.
Filmde, Hideshi adlı depresif bir adam, hayatından bıkmıştır ve intihar etmeye karar verir. Ancak ne yaparsa yapsın, kendini öldürememektedir. Bıçakla keser, tabancayla vurur, ip ile asar ama hiçbir şey işe yaramaz. Hideshi, vücudunun parçalarını kaybetmesine rağmen hala yaşamaktadır. Hideshi, bu durumun nedenini anlamaya çalışırken, acı çekmeye devam eder.
Film, Hideshi’nin kendini öldürme girişimlerinin giderek daha vahşi ve çılgınca hale geldiği sahnelerle ilerler. Hideshi, vücudunu çeşitli aletlerle parçalar, yakar, ezdirir ama hala canlıdır. Hideshi’nin arkadaşı Tomie de ona yardım etmeye çalışır ama başarılı olamaz. Tomie de Hideshi’nin durumundan etkilenir ve onunla birlikte acı çeker.
Film, Hideshi’nin vücudunun tamamen yok olduğu ve sadece kafasının kaldığı son sahneyle biter. Hideshi, kafasını da yok etmek için son bir girişimde bulunur ama başarısız olur. Film, Hideshi’nin kafasının hala konuştuğu ve acı içinde inlediği korkunç bir görüntüyle son bulur.