Bilinmeyen çevresel bakteri ve mantarların doğru şekilde tanımlanması, çeşitli endüstriler için çok önemlidir. Farmasötik üretim ortamlarının ve temiz odaların kalifikasyonu ve aktif izlenmesi için mikrobiyal tanımlama gereklidir.
Gıda bozulmasından veya kozmetik bozulmadan sorumlu kirleticiler daha iyi hedeflenebilir ve mikrop bilindiğinde kaynaklar daha iyi tanımlanabilir. Mikroorganizmaların kültürlenmesi, kimyasal boyama ve mikroskobik gözlem dahil olmak üzere klasik mikrobiyolojik yöntemler, bazı türlerin kimliğini ortaya koyabilir, ancak bu işlemler zaman alıcı ve yanlış olabilir. Modern biyokimyasal yöntemler, cins ve tür düzeyinde kesin ve güvenilir tanımlama sağlar.
Mikrobiyal tanımlama için altın standart yöntem, ribozomal DNA'nın (rDNA) karşılaştırmalı gen dizisi analizidir - özellikle, bakteriler için 16S ribozomal RNA geni veya mantarlar için LSU D2 bölgesi. Ribozomal DNA'nın (rDNA) karşılaştırmalı gen dizisi analizinin, on yıldan fazla bir süredir güvenilir bir şekilde kullanılan mikrobiyal tanımlama sistemi teknolojilerinin en yüksek doğruluğuna sahip olduğu gösterilmiştir.
EUROLAB, karşılaştırmalı rDNA sıralaması için MicroSEQ ID mikrobiyal tanımlama sistemini kullanır; bu, 20.000'den fazla doğrulanmış türden oluşan bir kitaplık ile hızlı ve doğru mikrobiyal tanımlama için kanıtlanmış bir yöntemdir.