Rus Ortodoks Kilisesi'nin talebi ve Temmuz 2015'de Başbakan Dmitriy Medvedev'in talimatıyla, son Rus Çarı İkinci Nikolay'ın evlatları Prens Aleksey Romanov ve Büyük Düşes Mariya Romanova'nın naaşlarının incelenmesi ve defni için bir çalışma grubu kurulmuştu. Çalışma grubu, Rusya Devlet Arşivi'nde bulunan naaşlarından elde edilen yeni bulgular doğrultusunda, yeni bir soruşturma açılmasını uygun bulmuştu. Soruşturma için Sankt-Petersburg'un Petropavlovsk Katedrali'nde bulunan İmparator İkinci Nikolay ile eşi İmparatoriçe Aleksandra'nın mezarının açılması kararı verildi.
Soruşturma kapsamında ayrıca, 2011'den sonra tespit edilen arşiv materyalleri incelenecek. Bu materyallerin, 1918-1924 yıllarında çara bağlı ordu tarafından yürütülen soruşturma ve bazı fiziksel kanıtlarla ilgili olduğu belirtildi. Rusya Soruşturma Komitesi, söz konusu incelemelerin ve soruşturmanın yapılması için dosyanın raftan indirilmesi kararı aldı.
Soruşturma, Yekaterinburg kenti yakınlarında toplu mezarın bulunması üzerine 1993'te açılmıştı. İnceleme sonucu toplu mezarda bulunan kemiklerin, öldürülen son Çar İkinci Nikolay ile ailesi ve maiyetine ait olduğu tespit edilmişti. Ancak suç işleyen kişilerin hayatta olmaması nedeniyle soruşturma 1998'de kapatılmıştı.
Öte yandan 29 Temmuz 2007'de toplu mezara yakın bir yerde Çar İkinci Nikolay'ın iki çocuğu Prens Aleksey ve Büyük Düşes Mariya'ya ait kemiklerin bulunması amacıyla yapılan arkeolojik kazıntılar sırasında, biri bir kadına, diğeri ise bir çocuğa ait kemik ve dişlere rastlanmıştı. Kemik ve dişlerin, yüksek sıcaklık belirtileri taşıdığı ifade edilmiş, yeni bulgular ışığında soruşturmanın yeniden başlamasına karar verilmişti. Yapılan incelemeler sonucu kalıntıların, Çar İkinci Nikolay'ın çocukları Prens Aleksey ve Büyük Düşes Mariya'ya ait olduğu tespit edilmişti. Yapılan tespit üzerine soruşturmanın kapatılması kararı alınmıştı.