Dünya Kupası Avrupa Elemeleri Play-offlar yarı final ilk maçında 24 Mart 2022 günü Türkiye ile karşılaşacak olan Portekiz'de defans oyuncusu Pepe, koronavirüse yakalanması nedeniyle kadrodan çıkartıldı.
Bir dönem Beşiktaş forması da giyen 39 yaşındaki savunma oyuncusu kadrodan çıkarılırken, Pepe'nin yerine Fransa Ligue 1'da Burak Yılmaz ve Zeki Çelik'in de yer aldığı Lille'de oynayan Tiago Djalo eklendi.
Pepe, Portekiz Milli Takımı ile tam 123 maça çıkarken 7 gol attı.