Robert Kolej ve Boğaziçi Üniversitesi Psikoloji bölümünü bitirdi. Köşe yazıları yazmaya başlamadan önce 3 yıl Asya'da dolaştı. Hindistan, Japonya ve ABD'de bulundu, çeşitli işlerde çalıştı. 1997-2005 yılları arasında Radikal gazetesinde çalıştı. 2005 sonbaharında Yeni Aktüel dergisinde köşe yazıları yazmaya başladı. 2006 Ekim'inden itibaren de bir süre RED dergisinde yazıları yayımlandı. 2007 Şubat ayından itibaren yine Radikal'de köşeyazıları yazmaya başladı. İki Genç Kızın Romanı adlı kitabı Kutluğ Ataman tarafından İki Genç Kız adıyla filme çekildi.
Kariyerinin başında bir süre reklam yazarlığı yapan Perihan Mağden, TRT 2'de yayınlanan “Okudukça” programında ve Kanal 6'da çalışmış, 1997’den itibaren Radikal gazetesinde köşe yazarlığı yapmaya başlamıştır. 2001 yılında İki Genç Kızın Romanı kitabını yazmak için köşe yazarlığına ara veren Perihan Mağden, 2002 yılında yeniden günlük köşe yazıları yazmaya başladığı Radikal gazetesinden 2005 yılında ayrılmıştır. 2005-2007 yılları arasında Yeni Aktüel ve Red dergisinde haftalık yazılar yazmıştır. 2006 yılında Yeni Aktüel'de yazdığı “Vicdani Red Bir İnsan Hakkıdır”adlı yazısının ardından “basın yoluyla halkı askerlikten soğutma” gerekçesiyle hakkında iddianame hazırlanmış, 3 yıla kadar hapis istemiyle yargılandığı davadan beraat etmiştir.
2007 yılında Radikal gazetesindeki yazılarına geri dönen Perihan Mağden, günlük yazılarına 2011 yılından itibaren Taraf gazetesinde devam etmiştir.
2008 yılında Perihan Mağden'in ilk romanı olan Haberci Çocuk Cinayetleri, Hollanda ve Rusya`da yayınlandı. Hollanda`da Hamide Doğan tarafından Felemenkçeye çevrilen Haberci Çocuk Cinayetleri adlı kitap, Athenaeum-Polak & Van Gennep tarafından basıldı. Rusya'da ise Perihan Mağden, kitabın yayınlanmasıyla birlikte Moskova`daki Gayatri Yayınevi`nin ilk Türk yazarı oldu.
Perihan Mağden Kitapları
Perihan Mağden Romanları
1991 Haberci Çocuk Cinayetleri, (kısa roman)
1994 Refakatçi
1997 Hiç Bunları Kendine Dert Etmeye Değer mi?
1998 Kapı Açık Arkanı Dön ve Çık!
1999 Fakat Ne Yazık ki Sokak Boştu
2001 Herkes Seni Söylüyor Sahi Mutsuz musun?
2001 Dünya İşleri
2002 İki Genç Kızın Romanı
2003 Topladım Dağılan Kalbimin Herrr Köşesini
2004 Korkma Bu Akşam Gelip Çalmam Kapını
2005 Best of Perihan Mağden
2006 Hangimiz Uğramadık ki Haksızlıklara?
2006 Politik Yazılar
2007 Biz Kimden Kaçıyorduk Anne?
2008 Son Yazılar
2010 Ali ile Ramazan
2011 Yaz Kitabı
2011 Kış Kitabı
2012 Yıldız Yaralanması