Prof. Dr. Mehmet Ali Ergün, TED Ankara Koleji’nden 1988 yılında mezun oldu. Gazi Üniversitesi Tıp Fakültesi’nden 1995 yılında mezun olduktan sonra 1999 yılında Tıbbi Genetik Uzmanı oldu. 2005 yılında Tıbbi Biyoloji ve Genetik alanında doktora ünvanını aldı.
Prof. Dr. Mehmet Ali Ergün, Ankara'da bulunan Gazi Üniversitesi Tıp Fakültesi' nde hastalarını kabul etmektedir.