4.6: Çekirdek
Çekirdek, kromozomal DNA şeklinde ökaryotik bir organizmanın genetik talimatları içeren membrana bağlı bir organeldir. Bu, mitokondrideki DNA'dan veya bu organellere özgü işlevleri yerine getiren kloroplastlardan farklıdır. Kırmızı kan hücreleri gibi bazı hücrelerin çekirdeği olmasa da, iskelet kas hücreleri gibi bazı hücrelerin birden fazla çekirdeği vardır, çoğu ökaryotik hücrenin tek bir çekirdeği vardır.
Çekirdekteki DNA histones gibi proteinlerin etrafına sarılır ve kromatin adı verilen bir DNA-protein kompleksi oluşturur. Hücreler bölünmediğinde,yani hücre döngülerinin interfaz kısmında olduklarında- kromatin dağınık bir şekilde düzenlenir. Bu, transkripsiyon işlemi sırasında, haberci RNA (mRNA) DNA koduna göre sentezlendiğinde DNA'ya kolay erişim sağlar. Ökaryotik bir hücre bölünmek üzereyken, kromatin belirgin, doğrusal kromozomlara sıkıca yoğunlaşır. İnsanlarda toplam 46 kromozom vardır.
Kromatin özellikle çekirdeğin nükleolus denilen bir bölgesinde yoğunlaşmıştır. Nükleolus ribozom üretimi için önemlidir, hangi protein içine mRNA çevirmek. Nükleolularda, ribozomal RNA sentezlenir ve proteinler ile birleşerek ribozomal alt birimler oluşturur, bu da daha sonra hücrenin sitoplazmasında işleyen ribozomlar oluşturur.
Çekirdeğin içi nükleoplazm denilen jel benzeri bir madde ile doldurulur. Nükleer zarf adı verilen iki lipid iki katmanından oluşan çift membran çekirdeği çevreler. Gözenek adı verilen küçük protein kaplı açıklıklar, çekirdekten hangi maddelerin girip çıkabileceğini kontrol eden nükleer zarfı noktalar. Örneğin, gözenekleri mRNA çekirdek bırakmak için izin, böylece protein çeviri doğrudan ribozomlar seyahat edebilirsiniz.