Mikrobiyal genomlar, kapsamlı kopyalar içerebilir. Genellikle ek açıklamaları, açıklamalı türlerden yeni dizilene aktarmayı isteriz.
Mevcut araçlar (örneğin, RATT, LiftOver, Kraken) ya türlerin ne kadar yakından ilişkili olduğuna dair belirli varsayımlar yapar ya da yeni genomda birden fazla eşleşme bulunduğunda, özellikle diziler oldukça benzerse, aktarılamaz.
Spesifik olarak, genlerin kapsamlı bir şekilde kopyalanabildiği sentetik bir biyoloji uygulamam var. Sırayla aynıdırlar, ancak birçok kez kopyalanırlar ve yeniden yerleştirilebilirler (yani, sadece birbirine bitişik değil). Yukarıda bahsedilen araçların hiçbiri, ek açıklamaların koordinatlarını özelliklerin birden çok kopyasına sahip genomlara aktaramaz.
Bu senaryoda ek açıklamaları aktaran önceden var olan araçlar veya yazılımlar var mı? Bunu sağlam bir şekilde yapmanın yolları için fikirler mi?