Hırsızlık olayında ağabeyini kaybetmiş, felçli bir durumda olan Jake Sully, Pandora adlı uzak bir gezegende görev almaya karar verir. Pandora’da, giderek azalan bir nüfusa sahip olan Na’vi adlı bir halk yaşamaktadır. Askeri bir şirket, bu bölgeyi ve buradaki kaynakları incelemek amacıyla Avatar adını verdikleri bir programı geliştirmiştir. Bu program, insanları kısmen insan, kısmen de Na’vi haline getirerek Pandora’ya göndermektedir. Botanist Dr. Grace Augustine ve Jake Sully, gönüllü olarak bu programa katılır ve Pandora’ya gönderilir. Jake, Pandora’ya ulaştığında felçli bedeni dönüşüme uğrayarak işlevsel hale gelir. Bu süreçte, Na’vi halkından Prenses Neytiri ile tanışan Jake, ansızın bir farkındalık yaşar. Gönderildiği araştırma misyonu, Jake’i sadece Pandora’nın kaynaklarını değil, aynı zamanda bu dünyanın kendi dünyasından gelen tehditlere karşı savunmasını sağlamak amacına dönüşür. Jake Sully, Pandora’daki yaşamın güzellikleri ve Na’vi kültürü ile bağ kurduğunda, insanların bu gezegeni sömürme niyetinde olan şirketin gerçek yüzünü keşfeder. Kendisini Na’vi halkının savunucusu olarak gören Jake, araştırma misyonunu bir direnişe dönüştürerek Pandora’yı kendi dünyasına karşı koruma kararı alır.