Bağırsak florasının bozulmasında ve düzeltilmesinde beslenme önemli bir yer tutar. Şeker ve tahıldan fakir beslenme, asidik yiyeceklerden ve hazır gıdalardan uzak durmak floranın düzeltilmesinde dikkat edilmesi gereken durumlardır. Gün içinde öğün sayısı ve beslenme saatleri de dikkat edilmesi gereken başka bir durumdur. Fakat çeşitli hormonal bozukluklar, ağır metal varlığı, bağırsakların sinirsel iletimi de florayı etkilediğinden beslenme düzeltilmenin yanı sıra başka tedavi teknikleri de kullanılmalıdır.