Emmental peyniri, Gravyer peyniri ve Rokfor peynirini büyükçe bir kasede harmanlayın. Fondü kabının içine soğan, sarmısak ve köpüklü şarap/şarabı koyup orta ateşte ısıtmaya başlayın. Şarap ısındığında ateşi kısarak peynirleri azar azar ekleyin. Peynirin topaklanmamasını sağlamak için zikzaklar çizerek karıştırın.
2 çorba kaşığı su ile mısır nişastasını ayrı bir kapta bulamaç haline getirin. Peynirler tamamen eriyince fondü kabını ateşten alıp mısır nişastası karışımını ekleyip karıştırın. Fondüyü beyaz biber ve muskat ile tatlandırın. Kısık ateşte 8-10 dakika daha karıştırarak pişirdikten sonra karışımı fondü ısıtıcısı üzerine alıp sıcak tutun.
Peynir fondüyü küp şeklinde doğranmış ekmek ile servis edin. İsteğe göre 3 peynirli fondünüz ile haşlanmış sebzeler, haşlanmış taze patates ve kornişon da servis edebilirsiniz.