NieR: Automata, 2B, 9S ve A2 androidlerinin hikayesini ve güçlü makineler tarafından istila edilen makine güdümlü distopyayı geri kazanma savaşlarını anlatıyor.
İnsanlık, başka bir dünyadan gelen mekanik varlıklar tarafından Dünya’dan sürüldü. Gezegeni geri almak için yapılan son bir çabayla, insan direnişi, işgalcileri yok etmek için android askerlerine bir kuvvet gönderir. Şimdi, makineler ve robotlar arasındaki bir savaş öfkeleniyor … Yakında dünyanın unutulmuş bir gerçeğini açığa çıkarabilecek bir savaş.