19. yüzyıl sonlarına doğru Allen Walker, Milenyum Kontu'nun ölülerin azap dolu ruhlarıyla yarattığı mekanik silahları yani Akuma denilen mahlukları yok eden bir Ruh Kovucu örgütüne katılmıştır. Allen'in hem lanetli bir göze, hem de ona Tanrı'nın havarisi olduğundan mükafat olarak verilen "Masumuyet"in gücünü taşıyan bir silaha sahiptir. Allen'in, yoldaş Ruh Kovucular ile Milenyum Kontu'nun dünyayı ve üzerinde yaşayan herkesi yok edebilecek nihai planını durdurması gerekir.