21.6: Aminoasitler
Amino asitler, proteinleri oluşturan monomerlerdir. Her amino asit, bir merkezi karbon atomundan veya bir amino grubuna (NH2), bir karboksil grubuna (COOH) ve bir hidrojen atomuna bağlı alfa (α)karbondan oluşan aynı temel yapıya sahiptir. Her amino asit ayrıca, R grubu olarak bilinen merkezi atoma bağlı başka bir atom veya atom grubuna sahiptir. Proteinlerde her biri farklı bir R grubuna sahip 20 ortak amino asit vardır. Amino asit dizisindeki varyasyon, protein yapısı ve işlevindeki muazzam varyasyondan sorumludur.
Bilim insanları "amino asit" adını kullanırlar çünkü bu asitler temel yapılarında hem amino grupları hem de karboksilik asit grupları içerirler. Tek bir büyük harf veya üç harfli bir kısaltma, amino asitleri temsil eder. Örneğin, V harfi veya üç harfli val sembolü valini temsil eder.
R grupları
R grubu (veya yan zincir) her amino asit için farklıdır. Yan zincirin kimyasal yapısı, amino asidin yapısını (yani asidik, bazik, polar veya apolar) belirler. Örneğin, amino asit glisin, R grubu olarak bir hidrojen atomuna sahiptir. Valin, metionin ve alanin gibi amino asitler doğaları gereği apolardır veya hidrofobik iken, serin, treonin ve sistein gibi amino asitler polardır ve hidrofilik yan zincirlere sahiptir. Lizin ve arginin yan zincirleri pozitif yüklüdür ve bu nedenle bu amino asitler aynı zamanda bazik amino asitlerdir. Prolin, halka benzeri bir yapı oluşturan amino grubuna bağlı bir R grubuna sahiptir. Prolin, amino grubu yan zincirden ayrı olmadığı için amino asidin standart yapısının bir istisnasıdır.
Bu metin bu kaynaktan uyarlanmıştır: Openstax, Biology 2e, Chapter 3.4: Proteins.