27 Ağustos 1922'de Afyonkarahisar'ın düşman işgalinden kurtarılışının ertesi günü olan 28 Ağustos günü şehre gelen Mustafa Kemal Paşa, Batı Cephesi Komutanı İsmet Paşa ve Genelkurmay Başkanı Remzi Paşa'nın karargah olarak kullandıkları Zafer Müzesi, Büyük Zafer'le sonuçlanan Başkomutanlık Meydan Savaşı'nın planlarının hazırlanması sebebiyle Cumhuriyet tarihinin en önemli anlarına tanıklık eden tarihi bir yapı.
İki katlı bir bina olan tarihi Zafer Müzesi'nin restorasyonu için, Eskişehir Kültür ve Tabiat Varlıklarını Koruma Bölge Kurulu'ndan izin alındı. Tarihi yapıda daha önceki yıllarda yapılan restorasyon sırasında ön cephe dolgu malzemesi olarak yerleştirilip üzeri sıva ile kapatılan traverten plakalar kaldırılarak, ahşap tavan yerine yapılan beton saçaklar ahşapla kaplandı. 1916 yılındaki resimlerde yer alan ahşap süslemeler yeni restorasyon sırasında yeniden yapıldı.