Taşova Kaymakam Vekilliği, Havsa, Ardahan, Kâhta ve Bozova Kaymakamlıkları, Mülkiye Müfettişliği, Ocak 1992-Nisan 1996 tarihleri arasında Adıyaman Valiliği, 1996-1999 yılları arasında ise Merkez Valiliği görevlerini ifa etmiştir. 6 ay süreyle İngiltere’de bulunmuş, “Yerel Yönetimlerin Denetimi” konusunda, İçişleri Bakanlığı yayınları arasında yayımlanan ayrıntılı bir rapor hazırlamıştır.
Cumhurbaşkanı tarafından 30 Eylül1999 tarihinde Danıştay Üyeliğine seçilen ve 22 Şubat 2000-26 Mart 2002 tarihleri arasında da Danıştay Genel Sekreteri olarak görev yapmıştır.
17 Mayıs 2006 tarihinde Mustafa Yücel Özbilgin, çalıştığı Danıştay 2. Dairesinde saldırgan Alparslan Arslan tarafından öldürüldü. 19 Mayıs 2006 tarihinde Ankara Kocatepe Camii'nde düzenlenen görkemli bir cenaze töreninin ardından toprağa verilen Özbilgin'in cenaze törenine eski başbakan Bülent Ecevit de doktorlarının karşı çıkmasına karşın katılmış ve törenden sonra rahatsızlanarak beyin kanaması geçirdi. Uzun süre yoğun bakımda tutulan Ecevit, 5 Kasım 2006'da vefat etmişti.
Alparslan Arslan bu saldırıyı, Danıştay II. dairesinin baş örtüsü hakkında aldığı kararlara tepki olarak gerçekleştirdiğini ifade etmiştir. Ancak Ergenekon İddianamesi'nde Danıştay Saldırısı'nın Ergenekon örgütü'nün talimatıyla gerçekleştirildiği savunulmuştur.25 Temmuz 2008'de kabul edilen Ergenekon davası iddianamesinde Danıştay Saldırısından sorumlu olarak Ergenekon örgütü gösterilmiş ve azmettiricisi olarak emekli Tuğgeneral Veli Küçük gösterilmiştir