RNA ölçümü, genetik ve moleküler biyoloji etrafında dönen araştırmalarda gerekli bir prosedürdür. Tek hücreli genomik içeren uygulamalarda uygulandığında doğru RNA ölçümü önemlidir. UV emilimi, elektroforez, flüoresan kullanan niceleme veya yeni nesil dizileme dahil olmak üzere RNA’yı ölçmek için birden fazla teknik kullanılabilir.
Otomatikleştirilmiş hücre sayaçları gibi yenilikçi teknolojiler bu tekniklere yardımcı olur ve başarılı RNA ölçümü için yüksek kaliteli numuneler hazırlamak için gereklidir. Bu blog yazısı, otomatik hücre sayımı teknolojisinin laboratuvarda izole edilmiş çekirdekleri doğru bir şekilde sayarak RNA izolasyonunun ve nicelemenin verimliliğini artırmaya nasıl yardımcı olabileceğini inceleyecektir.
RNA Sayımı Sırasında İzole Çekirdek Sayımlarının Doğruluğunun ve Güvenilirliğinin Artırılması
Tek hücreli analiz için uygun RNA ölçümü yapmak amacıyla, başarılı bir prosedür sağlamak için çeşitli hazırlık tekniklerinin tamamlanması gerekir. Çekirdeklerin genel hücre örneğinden izole edilmesi hayati bir önleyici adımdır. Bu, hedef çekirdeklerin hücre kalıntılarından ve ölü hücre gövdelerinden ayırt edilmesi için gerçekleştirilir. Çekirdekleri izole etmek, araştırmacıların RNA’yı hücre popülasyonu seviyesinden ziyade tek tek hücrede incelemelerine olanak tanır. Çekirdekleri hücre örneklerinden izole ederek, araştırmacılar gen ekspresyonunu ve hücresel süreçleri mikro ölçekte daha net bir şekilde inceleyebilirler.
Ayrıca, birçok laboratuvar tekniği, doğru RNA ölçüm sonuçları üretebilmek için yüksek kaliteli izole edilmiş çekirdek örnekleri gerektirir. Bilim adamları, otomatikleştirilmiş hücre sayaçlarına güvenerek, RNA ölçümü sırasında izole edilmiş çekirdek sayımlarının doğruluğunu ve güvenilirliğini artırabilir. Bir sonraki bölüm, otomatik hücre sayımının bu örnek olay incelemesini daha ayrıntılı olarak inceleyecektir.
RNA Sayımı Amaçları İçin Otomatik Hücre Sayımını Kullanma
Otomatik hücre sayaçları, izole edilmiş çekirdekleri bozulmamış hücrelerden ve kalıntılardan güvenilir bir şekilde ayırt ederek laboratuvar iş akışını kolaylaştırır. Özellikle araştırmacılar, tek hücreli genom araştırmaları için floresan tabanlı hücre sayaçlarına güvenirler.. Bu teknoloji, büyük hacimli numune gerektirmez ve numuneleri slaytlarda sunmadan çalışabilir, hem numune kaynaklarından hem de hazırlama süresinden tasarruf sağlar. Bununla birlikte, bu örnek çalışmada belirtildiği gibi, bu enstrüman, istenirse ek örnekler gerektirmeden çekirdekleri saydıktan sonra gerçekleştirilecek yüksek büyütmeli mikroskopi analizine izin veren hücre slaytlarını kullanma seçeneğine sahiptir.
Kaynak: https://www.denovix.com/blog/rna-quantification-counting-isolated-nuclei/