Yüksek teknolojili mucit fırlatma rampasında bir jet uçağı yap ama dikkatli ol, eski düşmanlar Pythor, General Kozu, Kılıç Ustaları'ndan oluşan taş ordusu ve General Cryptor içeri girip bütün samuray araçlarını çalmaya çalışıyor! Samuray X zırhıyla saldır ve işgalcileri lazer hapishanesine at. Sonra güçlü Samuray X motosikletiyle ya da yaptığın muhteşem jetle oradan uzaklaş!