Brüksel'de iki havaalanı bulunmaktadır. BRU Havaalanı, şehre 11 kilometre uzaklıkta olup şehre ulaşımı için birçok seçenek bulunmaktadır. Charleroi Havvaalanı, şehre 46 kilometre uzaklıkta bulunan daha küçük bir havaalanıdır. Avrupanın pek çok merkezinden Brüksel'e uçuşlar bulunmaktadır. Türkiye'den Brüksel'e İstanbul ve Antalya'dan aktarmasız uçuşlar bulunurken Türkye'nin hemen her havaalanından bir aktarmayla uçuşlar bulunmaktadır.
Avrupa'nın Köln, Amsterdam, Paris gibi birçok şehrinden Brüksel'e trenle ulaşmak da oldukça kolaydır. Çok sayıda tren seferi düzenleyen firma bulunmakta ve çokça şehirden tren seferi sıklıkla yapılmaktadır.