Kortizon kullanımı yaygındır ve çok çeşitli hastalıkların tedavisinde kullanılır. Temel olarak, vücuttaki tüm enflamatuar hastalıklar, prensipte kortizonla tedavi edilebilir. Bunlar arasında kronik inflamatuar bağırsak hastalığı, karaciğer veya böbrek iltihabı, multiplskleroz veya vasküler inflamasyon sayılabilir.
Uzun süreli tedavi ile yan etkiler ortaya çıkabilir. Ayrıca, kan basıncında ve kan lipitlerinde artışa yol açabilir. Kan şekerlerindeki artışa bağlı olarak diyabet gelişebilir. Kilo alımı birçok hasta tarafından şikayet edilen yan etkilerinden biridir. Dokuda su tutma, enfeksiyonlara karşı artan kırılganlık ve kortizon uzun süre alınırsa kalsiyum ve D vitamini ile tedavi edilmesi gereken kemik kırılganlığının (osteoporoz) artması vardır. Ayrıca glukokortikoid tedavisinden bağımsız olarak sigara içmemek de önemlidir: Sigara dumanı sadece romatizma geliştirme riskini artırmakla kalmaz, aynı zamanda hastalığı daha da kötüleştirir.