Metafiziksel olarak ruh kavramı bilimsel değildir, bilimsel olarak çalışılamamaktadır. İnsanlar, sinir sisteminin çalışmasından doğan etkiyi açıklayamadığı için bu özellikleri "ruh" denilen metafiziksel kavrama atfediyorlardı. Halk arasında kullanılan metafiziksel anlamı ile ruhun kanıtı olmadığı için bilim bu anlamda ruha inanmak veya inanmamak gibi bir yorum yapmaz.
İronik bir şekilde bilimde de "metafiziksel olarak ruh" anlamında değil, tam da "insanların açıklayamadığı özellikleri bilimsel olarak açıklayan" bir kavram olarak kullanılmaktadır.
Kaynaklar kısmına eklediğim "Ruh'' Kavramının Bilimsel Terminoloji ve Sinirbilim Çerçevesindeki Analizi... adlı yazı bu konuda daha ayrıntılı bilgi edinmenizi sağlayacaktır. Alıntı yapıyorum:
"Bilim dilinde "ruh" derken kastedilen, beynin faaliyetleri sonucu oluşan algıların ve davranışların tümüdür. Günümüzde zaten artık bu sözcük neredeyse tamamen bilimden çıkarılmış, bilim insanları kastetmek istedikleri şeyler için daha spesifik sözcükler belirlemiştir ("algı" gibi, "tepki" gibi, "düşünce" gibi, "duygu" gibi). Bunların hiçbirinin doğaüstü veya bilimsel olarak test edilemez olduğu iddia edilmez.
(...)
Eğer ki metafizik olan, bilimsel araştırma yöntemleriyle açıklanamayacak olan, maddeci olmayan bir "ruh" kavramından söz ediyorsanız, muhtemelen yanılıyorsunuz ve bilim neden ve nasıl yanıldığınızı size fazlasıyla gösterebilecek kadar bilimsel veriye şu anda sahip. Ancak eğer ki "sinir sistemimizin çalışmasından doğan sonuçların tamamı" için "ruh" sözcüğünü kullanıyorsanız ve bir bireyin "ruh halinin", davranışlarının, vb. özelliklerinin tamamiyle bilimsel olarak, somut ve maddeci bir şekilde açıklanabileceğini ileri sürüyorsanız, bilimsel arenada herhangi bir sorun yaşamadan fikirlerinizi aktarabileceğinizi düşünüyoruz. Zira dediğimiz gibi bu şekilde "zeka, davranış, algı" gibi sinirsel ürünlerin toplamına "ruh" deyip geçen; ancak doğaüstü veya metafizik bir olguya işaret etmeyen birçok sinirbilimci (özellikle de psikolog) şu anda bilim camiasında bulunuyor."