Sovyetler Birliği zamanında Dağlık Karabağ, ''Dağlık Karabağ özerk oblastı'' olarak Azerbaycan Sovyet Sosyalist Cumhuriyetine bağlı idi. Ermenistan, Şubat 1988 de Dağlık Karabağ'ın Ermenistan'a bağlanmasını istedi. 1991-1993 arasında sıcak savaşta Ermeniler, içerde Ermeni çetecilerin desteği ile Dağlık Karabağ'ı işgal etti.
Savaştan önce Dağlık Karabağ'a giden Türk gazeteci Muammer Elveren anlatıyor:
''Ermeni çeteleri, Azeri köylerine otomatik silahlar; roket atarlar ve bombalarla saldırıyordu. Sovyet Kızıl Ordu birlikleri ve Sovyet tankları kıpırdamıyordu.''
Etnik çatışmalar ve savaş sırasında başta Hocalı olmak üzere Ermeniler tarafından 7 yerleşim alanında katliam yapıldı.
Savaşta Ermenilerin kullandığı ağır silahlar Sovyetlerin dağılmasından sonra Rusya tarafından boşaltılan üslerden kalmıştı. Ayrıca Rusya, savaş sırasında da el altından Ermenileri destekledi. Buna rağmen Azerbaycan Rusya'dan ayrılmıyor. Halen de Bağımsız Devletler Topluluğu üyesidir.
1813 ve 1827 yıllarında Kaçar Türkleri devleti ile Çarlık Rusyası arasında yaşanan savaşlar sonucunda Azerbaycan Kuzey ve Güney olarak ayrıldı. Aras nehri Azerbaycan'ı, kuzey ve güney olarak ikiye böldü. Şimdi Kuzey ve Güney Azerbaycan'ın yeniden birleşmesi İran'ın korkulu rüyasıdır.