Varşova Hayvanat Bahçesi'nin yöneticisi Jan Żabiński (Johan Heldenbergh) ve eşi Antonina Żabiński (Jessica Chastain), hayvanat bahçesinin gelişmesi için tüm imkanları seferber etmekte, hayvanlarla yakından ilgilenmektedir. Ancak bu mutlu hayatları, 2. Dünya Savaşı'nın başlangıcını temsil eden olayla, Nazi Almanyası'nın Polonya'yı işgaliyle uzak bir hayale dönüşecektir. Hayvanların bir kısmı bombardımanda ölür, hayvanat bahçesi kapatılır. Ancak Żabiński çifti boş durmayacak, boş kalan kafeslerde, kendi evlerinde ve havyanat bahçesine bağlı diğer tesislerde ellerinden geldiğince çok sayıda Yahudi'yi saklayacaktır.
Filmde Jan ve Antonina Żabiński çiftinin gerçek öyküsü, Diane Ackerman'ın yazdığı romandan uyarlanarak beyazperdeye aktarıldı.