Papaz Santoro’nun öldürülmesiyle ilgili olarak da Erdoğan, bu cinayeti kimsenin tasvip etmediğini belirterek, "Trabzon’daki cinayet Türkiye’yi derinden yaralamıştır" diye konuştu. Erdoğan, sözlerini şöyle sürdürdü:
"Santoro’nun ölümü, karikatür krizine bağlanamaz. Böyle olmakla birlikte bu cinayet, uygarlıklar ve halklar arası diyalogun mimarı olan Türkiye’yi derinden yaralamıştır. Tek tesellimiz, katil zanlısının kısa sürede yakalanmış olmasıdır."
Batı dünyasında İslam dininin "ılımlı" ve benzeri sınıflandırmalara tabi tutulmasının anlamlı olmadığını kaydeden Erdoğan, "Gerçek İslam, şiddetin her türünü kategorik biçimde reddetmektedir" dedi.