Özellikle, Alman sermayeli iki şirketin dahil olduğu olası bir yolsuzluk planı hakkında not edildi. Bu Ferrostaal ve EnerSys-Hawker. Bu şirketler, bitmiş piller yerine Arjantin denizaltı pillerinin temininde yer aldı.
Bayerischer Rundfunk'a göre, bozulmuş bir program sonucunda yeni piller hiç yeni olmayabilir. Sahte programın iddia edildiği gibi denizaltıların ölümüne yol açan onarımlar sırasında acil durum bataryalarının takılmasına neden olduğu iddia edildi.
Denizaltının iletişim kurmayı kesmesinden kısa bir süre önce, mürettebatın kısa bir devre ve Arjantin Donanması üssüne bir yangın ile ilgili mesaj gönderdiği bildirildi. Nedenin pillerin devre dışı bırakılabileceği belirtilmektedir. Aynı zamanda, tekne bir süre daha suyun altında hareket etmeye devam etti. Daha önce bir denizaltıda hidrojen tahliyesi rapor edildi, bu da patlamaya neden oldu. Önceden, ateş Donanması üssünün üssüne transfer bildirilmemişti.
Dizel-elektrik denizaltılarının "San Juan" ölüm nedenleri hakkındaki resmi sonuçlar henüz yayınlanmadı.