Sudan tarihten bugüne birçok medeniyete ev sahipliği yapmıştır. 6. yüzyılda bölge halkının Koptik Hristiyanlığı kabul etmesinin ardından Nil kıyılarında kurulan krallıklar 14. yüzyılda Müslüman Araplar tarafından fethedilmiştir. 1821 yılında Osmanlı tarafından fethedilen Sudan'da Osmanlı egemenliği 1885 yılında sona ermiştir.
Ardından 1899 yılında Sudan, İngiliz-Mısır ortak yönetimi altına girmiştir. Sudan'ın doğusunda yer alan Darfur Sultanlığına da İngiliz-Mısır ortak yönetimi tarafından son verilerek bu topraklar da Sudan'a katılmıştır. Sudan, 1 Ocak 1956 tarihinde bağımsızlığına kavuşmuştur. Ülkenin bağımsızlığına kavuşmasının ardından etnik ve dini farklılıklar nedeniyle ciddi sorunlar yaşanmıştır. Bu farklılıklar neticesinde siyasi kutuplaşma başlamış ve ülkede istikrarlı bir yönetim kurulamamıştır. İç barışın sağlanamadığı ülkede Müslüman-Arap kuzeyle, Animist-Hıristiyan güney arasında iç savaşlar yaşanmıştır. Bu savaşlar sonunda Güney Sudan 9 Temmuz 2011 tarihinde bağımsızlığını ilan etmiştir. Güney Sudan'ı tanıyan ilk ülke Sudan olmuştur.