3D baskının en ilginç kullanım alanlarından bir tanesi de cerrahi operasyonlar. Bugüne kadar 3d baskı birçok karışık cerrahi operasyonda doktorların yanında oldu. Birçok canın kurtulmasında 3D baskı etkin rol oynadı. Süreç çoğunlukla operasyon yapılacak yerin taraması yapıldıktan sonra elde edilen verinin modellenerek baskıya konulmasıyla ilerliyor. Ortaya çıkan katı obje operasyon alanının şeklini aynen gösteriyor. Bu da ciddi bir cerrahi operasyon yapılmadan önce prototiple operasyonun planlanmasına olanak sağlıyor.