Lezyonlar erkek hastalarda genellikle penis gövdesinde, glansta ya da perianal bölgede, kadın hastalarda vulva, vajen, serviks ve perianal bölgelerdedir. Primer veya metastatik lezyonlar nadiren kalça, parmaklar, dudaklar, karın ya da göğüste olabilir. Ağız içi lezyonlar olabilir. Ancak son derece nadirdir.
Yumuşak şankr tedavi edilmezse ya da tedavide geç kalınırsa komplikasyon olarak unilateral ya da bilateral lenfadenitis gelişebilir. Başlangıçta sert olan lenf bezi zamanla yumuşak ve fluktuasyon verir hale gelir. İçindeki materyel aspire edilmezse, lenf bezi supüre olur. Bazen üzerine sekonder infeksiyonlar yerleşebilir.