3. Prostat kistleri- taşları: Prostat bezi içindeki sperm kanallarını tıkayan taşlar veya kistler özellikle ağrılı orgazma sebep olabilir. Bunun için transrektal ultrason veya prostat MR ile görüntüleme yapılabilir. Tıkayıcı kistler cerrahi ile tedavi edilebilmektedir.
4. Ağrılı mesane- interstisyel sistit: Mesane yüzey epitelinin kronik hastalığıdır. Hastalarda karın alt bölgesinde ağrı, sık idrara gitme, cinsel ilişki sırasında ve boşalmada ağrı görülebilir. Sistoskopi tanı koymada yardımcıdır.
5. Prostat kanseri: Prostat kanseri genellikle 50 yaş üstü erkekleri ilgilendirse de ailesinde daha önce kanser saptanan erkeklerde 40 yaş sonrası görülebilmektedir. Çoğunlukla sessiz seyreder ancak ağrılı, kanlı boşalma durumunda akılda bulundurulmalıdır.
6. Ameliyatlar: Kasık, yumurtalık, prostat için uygulanan cerrahiler sonrası ağrılı orgazm görülebilir. Kasık fıtığı ameliyatı, prostat ameliyatları, idrar yollarında yapılan ameliyatlar iyileşme tamamlanana kadar şikayetlere sebep olabilir.
7. Bazı ilaçlar: Özellikle orgazm mekanizmalarını bozan ilaçlar (antidepresanlar) erkek cinsel sorunlarına ve ağrılı orgazma sebep olabilirler.
8. Pudental nöropati: Diyabet, multipl skleroz (MS) veya cerrahiye bağlı oluşan sinir hasarları sonucunda cinsel organlarda ve makatta ağrı, ağrılı orgazm görülebilir.