Samsunspor 1979-80 sezonu, kırmızı beyazlı ekibin profesyonel liglerdeki on beşinci, 2. Futbol Ligi'ndeki altıncı sezonu, kuruluşunun on beşinci yılıdır. Resmî kuruluşunun on beşinci yılında 2. Futbol Ligi ve Türkiye Kupası'nda mücadele eden kulüp kupada 5. turda elenmiş, ligi ise A Grubu3.sü olarak tamamlamıştır. Takım, sezonun ilk 15 haftasını Kamuran Soykıray, 16. haftadan itibaren ise Nuri Asan yönetiminde geçirmiştir. Sezonun en çok gol atan oyuncuları 9'ar golle Hakkı Bayrak ve Sinan Ünal olmuştur.