1980'de New York'ta doğdu. Annesi Georgia, kızını sperm bankasından edindiği sperm yoluyla dünyaya getirdi ve tek başına büyüttü. Merritt Wever, New York'taki Fiorello H. LaGuardia Lisesi Sarah Lawrence College'a gitti.
Birçok dizi ve filmde aldığı kısa rollerden sonra 2009'da başlayan Nurse Jackie dizisiyle büyük ün sahibi oldu. Dizideki Zoey Barkow rolünü 7 sezon sürdüren Wever, ayrıca Alejandro G. Iñárritu'nun Birdman filminin de yıldızlarla dolu kadrosunda yer aldı. 2015'te The Walking Dead dizisine Dr. Denise Cloyd rolüyle katılan Wever, daha sonra Godless dizisinde Mary Agnes McNue karakterini canlandırdı.