Aslında birbirlerini tanımaları enzim substrat ilişkisine benziyor zayıf hidrojen bağlarının bağ sayısı adeninve timinde ikiyken sitozon ve guaninde üçtür. birbirlerini yap boz gıbı tamamlıyorlar. Aynı zamanda adenin ve guanin çift halkalı iken timin ve sitozin tek halkalıdır.
Eğer a-g ,t-s bağlansaydı dna da çok büyük şekil sorunu olacaktı ve dna sarmal yapısını koruyamazdı.