Enfeksiyon hastalıklarının tanısındaki ilerlemeler,antimikrobiyallerin gittikçe artan sayıda kullanıma girmesi ve antimikrobiyallere karşı gelişen direnç pratik hekimlikte bir karmaşayı da beraberinde getirmiştir. Ayrıca son 15-20 yılda yeni etkenlerin bulunması ve kliniği çok iyi bilinen hastalıkların nedeni olarak mikroorganizmaların bulunması sonucunda etyolojisi belirsiz hastalıklarda enfeksiyöz nedenlerin yoğun bir şekilde araştırılması enfeksiyon hastalıklarını ayrıcalıklı bir yere getirmiştir.