Mikroorganizmalar, DNA bazlı tanımlama yöntemlerinin yanı sıra hücresel lipit bileşimlerine göre de sınıflandırılabilmektedir. En yaygın olarak analiz edilen lipitler, fosfolipit yağ asitleridir (PLFA'lar). PLFA'lar hücre zarlarının birincil bileşenidir ve tüm canlı organizmalarda bulunur. Yağ asitleri zincir uzunluğuna, doymamışlıkların sayısına ve konumuna ve ek moleküllerin konumuna (örneğin metiller, hidroksiller ve siklopropan halkaları) göre ayırt edilir.
Mikroorganizmalarda yağ asitlerinin kromatografik analizi, türleri tanımlamak için bir veri tabanıyla karşılaştırılan bir parmak izi sağlar. Bakterilerin ester bağlantılı yağ asitleri veya Archaea'nın eter bağlantılı yağlı alkolleri, kapiler gaz kromatografisi veya kütle spektrometresi ile gaz kromatografisi ile analiz edilir.[1]