Jump City, Saico-Tek adlı bir Japon ninja tarafından saldırıya uğradı. Genç Titanlar onu yakalarlar ve Saico-Tek'in "Brushogun" adlı bir adam tarafından gönderildiğini keşfederler. Çekiciyle yangın musluklarına yaptıklarından sonra gizemli bir şekilde kaybolur. Daha sonra, Titanlar ustasını aramak için Japonya'nın Tokyo kentine giderler. Oraya vardıktan sonra, dil sorununu hallettikten ve Gorgo benzeri dev bir sürüngenle savaştıktan sonra, Titanlar, Komutan Uehara Daizo liderliğindeki Tokyo'nun kendi doğaüstü savunma gücü olan Tokyo Birlikleri ile tanışıyor. Daizo, Brushogun hakkında sorgulandığında Brushogun'un bir şehir efsanesinden başka bir şey olmadığını savunuyor. Takibi devam ettirmek için hiçbir yerde kötülük bırakmayan Titanlar, Tokyo'nun tadını çıkarmaya karar veriyor.
Teen Titans: Trouble in Tokyo, filmi DC Comics'in Teen Titans süper kahramanlık çizgi romanlarından uyarlanmıştır.
Teen Titans: Trouble in Tokyo filmi Teen Titans (2003 - 2006) dizi serisinin sonu olarak geçmektedir.
Teen Titans: Trouble in Tokyo filmi Türkiye de dijital platformlarda Türkçe dublajlı bir şekilde yayınlanmıştır. Film Cartoon Network'ün Türkiye televizyon kanalında ise 2016-2017 tarihleri arası Türkçe dublaj ve çift dil seçeneğiyle orijinal İngilizce dilindeki dublajı ile yayınlanmıştır.