HTC One M9+'ın M9'a göre belirli farkları var. Bunlardan biri boyutları ve ağırlığı. Cihaz M9'dan daha uzun ve biraz daha ağır. 5.2 inç'lik 2K çözünürlüğünde Super LCD3 ekrana sahip. Ayrıca M8'den bildiğimiz Duo Camera yani çift kamera sistemi M9+'ta bulunuyor. Diğer belirgin bir fark ise parmak izi okuyucu. Ancak parmak izi tarayıcısı mekanik bir düğme değil. Sadece tarayıcı olarak ön tarafta alt kısımda bulunuyor.