Süper Ajanlar, çalınan kıymetli bir metaryelin peşine düşen iki ajanın hikâyesini mevzu ediyor. Yetenekli fakat asi bir gizmen olan Vladimir, çaylak bir gizmen olan Hector ile birlikte çalışmaya adım atar. Hususi bir materyal olan Radiuzite’ın çalışılmış olduğu haberini alan Vladimir ve Hector, süre kaybetmeden araştırmalara adım atar. Radiuzite’yi bulmaya çalışan ekip, kendilerini sıkıntılı bir mücadelenin içinde bulur.