İstanbul'daki bir çok camide olduğu gibi Cerrahpaşa Camii'nin de etrafı otoparkla kuşatılmış. Uçta görünen iki pencereli taş duvardan da anlaşılacağı gibi bu arsa işgalden önce camiye aitmiş. Otoparka bitişik, beyaz kubbeli yapı ise Cerrah Mehmet Paşa'nın eşi Gevher Sultan tarafından yaptırılan medresedir. Bu medrese günümüzde Deniz Feneri Derneği'ne hizmet vermektedir. Medrese önünde ağacın yanındaki ahşap ev ise caminin sonradan yaptırılan ahşap kütüphanesidir. Burası da halen şahıs mülkiyetinde ev olarak kullanılmaktadır. Önde cami bahçesinde Cerrah Mehmet Paşa'nın türbesi görünmekte.