Araştırmacılar Parkinson Hastalığı İçin İki mRNA Biyomarker Tanımladı
HNF4A ve PTBP1 mRNA’larının ekspresyon seviyesi, Parkinson hastalığı hastalarının kanında kontrollere kıyasla farklıydı, araştırmacılar bugün Ulusal Bilimler Akademisi Bildirileri’nde bildirdiler. HNF4A mRNA seviyesi kötüleşen hastalık evresi ile korelasyon göstererek hastalık şiddetini ölçebileceğini düşündürmektedir. Bu genlerin her ikisi de daha önce diyabetle ilişkilendirilmiş ve iki hastalık arasındaki bağlantıyı sıkılaştırmıştır.
Franklin’in Jose Santiago ve Judith Potashkin makalelerinde, “Biyobelirteç keşfi ve validasyonu, PD’nin klinik yönetiminin iyileştirilmesi için önemli bir adımdır.” “Spesifik olarak, PD’nin klinik seyrinin izlenmesinde yararlı olan biyobelirteçler etkili terapötiklerin geliştirilmesi için gereklidir.”
İkili, Parkinson hastalığı için moleküler bir imza aramak için, transkriptomik ve ağ tabanlı bir meta-analizin hastalığın önemli düzenleyicilerini ve biyobelirteçlerini ortaya çıkarabileceğini belirledi.
Santiago ve Potashkin, toplam 83 hasta ve 46 sağlıklı kontrol olmak üzere, Parkinson hastalığı üzerine yapılan dört farklı mikrodizi tabanlı çalışmadan veri topladı. İfade Verileri Bütünleştirici Meta Analizi kullanılarak ikili, dört çalışma boyunca tutarlı bir şekilde farklı şekilde ifade edilen 2.781 geni ortaya çıkardı. Bunlardan 680’i yukarı regüle edilirken 2.101’i aşağı regüle edildi.
Bir gen yolu analizine dayanarak, araştırmacılar, bu farklı şekilde eksprese edilmiş genlerin birçoğunun, endoplazmik retikulumdaki protein işleme, T-hücresi reseptörü sinyali, tip 2 diyabet ve daha fazlası ile ilgili yollarda ve süreçlerde yer aldığını belirtti.
Ek olarak, NetworkAnalyst kullanılarak yapılan ağ analizi, HNF4A’nın anahtar bir hub geni olduğunu, PTBP1’in Parkinson hastalığı hastaları arasında en önemli ölçüde aşağı regüle edilmiş gen olduğunu buldu.
HNF4A, karaciğerde glukoneogenezin aktive edilmesinde rol oynayan ve diyabet, enflamasyon ve lipit metabolizması ile bağlantılı bir ana metabolik düzenleyici faktördür. Bu arada PTBP1’in, pankreas cells hücrelerinde insülin mRNA’ların stabilizasyonunu ve translasyonunu teşvik ettiği düşünülmektedir.
Ağ analizlerine dayanarak, Santiago ve Potashkin 101 Parkinson hastalığı hastasının ve 91 sağlıklı kontrolün kanındaki HNF4A ve PTBP1 mRNA seviyelerini ölçtüler. QPCR bazlı bir analiz, HNF4A ve PTBP1’in kontrollerle karşılaştırıldığında hastalarda önemli ölçüde yukarı regüle veya aşağı regüle olduğunu göstermiştir.
Gerçekten de, bu iki genin ifade seviyelerinin yüzde 90 duyarlılık ve yüzde 80 özgüllüğü olan hastaları sınıflandırabildiğini ve HNF4A ve PTBP1 mRNA düzeylerinin yaş ve cinsiyet gibi diğer değişkenlerden bağımsız olduğunu bulmuşlardır.
Ayrıca, HNF4A mRNA seviyeleri ile PTBP1 mRNA seviyeleri arasında negatif bir korelasyon ve HNF4A mRNA seviyeleri ile hastalık evresi arasında bir korelasyon bulmuşlardır, bu da HNF4A mRNA düzeylerinin Parkinson hastalığı hastalarını hastalığın erken evrelerinde ve takibinde faydalı olabileceğini düşündürmektedir. hastalık şiddeti.
İki varsayılan biyobelirteç seviyesi de zamanla değişmiştir. 50 Parkinson hastalığı hastası ve 46 sağlıklı kontrol numunesi kohortunda, araştırmacılar HNF4A mRNA seviyelerinin Parkinson hastalığı hastalarında kontrollere kıyasla zamanla azaldığını, PTBP1 mRNA seviyelerinin ise üç yıllık takiplerde kontrollere göre arttığını bulmuşlardır. up dönemi.
Santiago ve Potashkin, “Bu çalışmada tanımlanan boyuna dinamik biyobelirteçler PD için hastalık değiştirici tedavileri izlemek için yararlı olabilir.” Dedi.
02 Şubat 2015 Pazartesi, GenomeWeb