Kermit'in Bataklık Yılları dünyanın en ünlü kurbağasının nasıl bataklığını terk ettiğinin ve kendisiyle birlikte herkesin hayatını nasıl değiştirdiğinin hikayesi. Genç Kermit,meraklı ve eğlence seven kurbağa, en sevdiği arkadaşları Goggles ve Croaker ile takılmaktadır. Aynı zamanda da bataklığın dışındaki hayatı merak etmektedir. Goggles bir hayvan satıcısı tarafından yakalanınca Kermit ve Croaker onu kurtarmak üzere yola çıkarlar.