UEFA Avrupa Ligi'ndeki temsilcilerimiz Beşiktaş ve Trabzonspor'un 2. Tur'daki rakipleri belli oldu. UEFA'nın Nyon'daki genel merkezinde yapılan kura çekiminde Beşiktaş, Portekiz'in Braga takımı ile, Trabzonspor ise Hollanda'nın PSV Eindhoven takımı ile eşleşti.
Çift maçlı eleminasyon sistemine göre 32 takımın mücadele edeceği 2. turda ilk maçlar 16 Şubat, rövanş karşılaşmaları ise 23 Şubat 2012 tarihinde oynanacak. Trabzonspor ilk maçını kendi evinde oynarken, Beşiktaş, PSV ile deplasmanda karşılaşacak.
16 takımlı 3. tur karşılaşmaları ise 8 ve 15 Mart tarihlerinde oynanacak. Trabzonspor PSV'yi elemesi halinde, Stoke City-Valencia eşleşmesinin galibi ile 8 Mart'ta deplasmanda karşılaşacak. Beşiktaş ise 3. tura yükselirse, Lazio- Atletico Madrid eşleşmesinin galibi ile 8 Mart'ta yine deplasmanda oynayacak.
Beşiktaş, UEFA Avrupa Ligi E Grubu'nu 12 puanla birinci sırada tamamlayarak, Trabzonspor ise UEFA Şampiyonlar Ligi B Grubu'nda 7 puanla üçüncü olarak UEFA Avrupa Ligi 2. tur'a katılmaya hak kazanmıştı.