3D Genom Etkileşimlerini Ortaya Çıkaran Teknik
MIT'deki araştırmacılar, genom bölümlerinin üç boyutlu etkileşimlerini benzeri görülmemiş ayrıntılarla analiz etmelerine izin veren bir yöntem geliştirdiler. Teknik, bilim insanlarının genetik hastalıkların kökenini ve ilerlemesini araştırmasına ve onlar için yeni terapötik hedefler belirlemesine izin verebilir. Region Capture Micro-C adı verilen yeni yaklaşım, genomun bir bölümünü küçük ve tekdüze parçalara ayırmak için bir enzim kullanmayı ve ardından hücre çekirdeğinde birbiriyle etkileşime gireceği tahmin edilen genom parçalarını tekrar birbirine bağlamayı içeriyor. Araştırmacıların oluşturduğu sonuçta ortaya çıkan haritalar, gen ekspresyonunu kontrol etmek için genomun bölümlerinin birbirleriyle nasıl etkileşime girdiği hakkında önceden bilinmeyen bir dizi bilgiyi ortaya çıkarabilir.
Genetik ifade, gen ifadesini motive etmeye yardımcı olan promotörler olarak adlandırılan alanlar gibi, genlerin aktivitesini düzenleyebilen genom alanlarını içeren karmaşık yapıda bir olaydır. Bu bölgelerden bazıları etkiledikleri genin hemen yanında yer alırken, diğerleri uzakta yer alır ve gen ekspresyonunun hassas kontrolünü sağlamak ve farklı bölgeleri bir araya getirmek için genomun 3D uzayda bükülmesini gerektirir.
Bugüne kadar, tüm bu etkileşimleri çözmek ve nasıl çalıştıklarını, genetik hastalığı nasıl etkileyebileceklerini tam olarak anlamak çok karmaşık ve pahalıydı. Bununla birlikte, genom etkileşimlerinin nüanslarını takdir etmek, bu tür hastalıklara ışık tutabilir ve araştırmacıların yeni tedaviler geliştirmesine olanak sağlayabilir.
Araştırmaya katılan bir araştırmacı olan Viraat Goel, “Araştırmacılar artık genler ve düzenleyicileri arasındaki etkileşimleri uygun maliyetle inceleyebilir, bu da yalnızca bizim için değil, aynı zamanda yöntemimize ilgi gösteren düzinelerce laboratuvar için de bir olasılıklar dünyası açabilir. Araştırma topluluğuna, gen düzenlemesini yönlendiren mekanizmaları çözmelerine yardımcı olacak bir araç getirmekten heyecan duyuyoruz.” dedi.
Yeni yaklaşım, her şey yerine genomun bir hedef alanına odaklanmayı, analizle ilişkili maliyetlerin ve zamanın büyük ölçüde azaltılmasına yardımcı olmayı, ancak yine de çok ayrıntılı veriler elde etmeyi içeriyor. Çalışmaya katılan bir diğer araştırmacı Anders Sejr Hansen, “Artık ultra yüksek çözünürlüklü 3D genom yapısı haritalarını çok uygun bir fiyata elde etmek için bir yöntemimiz var. Önceden, finansal olarak erişilemezdi çünkü yüksek çözünürlük elde etmek için milyarlarca olmasa bile milyonlarca dolara ihtiyacınız olacaktı. Tek sınırlama, tüm genomu elde edememenizdir, bu nedenle yaklaşık olarak hangi bölgeyle ilgilendiğinizi bilmeniz gerekir, ancak çok uygun fiyata çok yüksek çözünürlük elde edebilirsiniz.” dedi.
Kaynak: https://www.medgadget.com/
Kategori: BİLİMSEL GÜNDEM
DİĞER Haberler
Röportaj: Doç. Dr. Doğan Yücel ile "Türk Biyokimya Derneği"ni ve Biyokimya Alanındaki Gelişmeleri Konuştuk
KATEGORİLER
DİJİTAL MAGAZİNLER
2023 - Sayı 1
2022 - Sayı 1
2021 - Sayı 2Diğer Dijital Magazinlerimiz