Dietrich Grönemeyer'in 15 dile çevrilmiş popüler fantastik kitabından uyarlanan film, 12 yaşındaki Nano'nun öyküsünü perdeye taşıyor! Şeytani profesör Schlotter'ın planının tanığı olan Nano, büyük babasına enjekte edilen bir virüs sebebiyle zorlu bir sınavın eşiğine gelir. Nano ilk olarak Dr. X'ten yardım ister. Fakat Micro Minitec adlı bilim adamının aklına daha yaratıcı bir fikir gelir. Nano'yu küçülterek, büyük babasının vücuduna yollama kararı alırlar.