Özel Mahkemeler (Courts of Special Jurisdiction) Özel Mahkemeler Kongre'nin kararı sonucu kurulur. Adının özel olmasının sebebi belirli bir alanda uzmanlık mahkemesi olmasıdır. Halen üç tane bulunan Özel Mahkemeler'in en önemlisi İddia Mahkemesi'dir (Court of Claims). Amerika Birleşik Devletleri aleyhine suçlama ve iddialarda bulunanların davası bu mahkemelerde görülür. Diğer iki Özel Mahkeme ise Gümrük Mahkemesi (Court of Customs) ile Gümrük ve Patent Üst Mahkemesi (Court of Customs and Patent Appeals)'dir.