Hrant Dink suikasitı soruşturması iki koldan yürüyordu. Birincisi cinayet davası olarak İstanbul'da görüldü. İkincisiyse ihmali bulunan kamu görevlileriyle ilgili. Bu kapsamda dönemin Trabzon İl Jandarma Komutanı Albay Ali Öz, İstihbarat Şube Müdürü Yüzbaşı Metin Yıldız, istihbarat şubesinde görevli Astsubay Okan Şimşek, Uzman Çavuşlar Veysal Şahin ve Önder Araz Trabzon 2'nci Sulh Ceza Mahkemesi'nde yargılandı. Mahkeme, Dink'in öldürüleceğinin Coşkun İğci tarafından bildirilmesine rağmen gereğini yapmadıkları gerekçesiyle görevi kötüye kullanmaktan Öz ve Yıldız'ı 6, diğer 3 sanığı da 4'er ay hapse mahkûm etmişti. Temyiz üzerine kararı inceleyen Yargıtay Başsavcılığı, İğci'nin Yasin Hayal'den öğrendiği Dink cinayetini 6 ay önceden bildirmesine rağmen sanıkların, "Bu olayları anlatırsan, can güvenliğin tehlikeye düşer" diye tehdit ettiklerini kaydetti. Başsavcılık, bilgiyi Jandarma Genel Komutanlığı'na bildirmeyen sanıkların, Dink'in ölümünden bir gün sonra 20 Ocak 2007'de, istihbarat yeni öğrenilmiş gibi Haber Kayıt ve Bildirim Formu düzenlediklerini kaydetti. Başsavcılık sanıkların "evrakta sahtecilik" suçu işlediklerini ve Ağır Ceza Mahkemesi'nde yargılanmalarını istedi. 11'inci Ceza Dairesi, savcılığı haklı bulursa sanıklar 3 yıldan 8 yıla kadar hapisle yargılanacak.