B1525 adlı bir koronavirüs varyantı, küresel varyant izleme listesine en son eklenenlerden biri haline geldi ve Public Health England tarafından araştırılan varyantlar listesine dahil edildi.
Bilim adamları bu varyantı dikkatle izliyorlar, çünkü virüsün insan hücrelerine tutunan kısmı olan başak proteinini oluşturan gende birkaç mutasyon var. Bu değişiklikler, virüsün bağışıklık sisteminden kısmen kurtulmasına izin veren ve ilk olarak Güney Afrika (B1351) ve Brezilya’da (P1) bulunan varyantlarda bulunan ve giderek daha iyi bilinen E484K adlı mutasyonun varlığını içerir.
Bunun B1525 için ne anlama geldiğine dair bir bilgi olmasa da, E484K’nın COVID aşılarının ne kadar etkili olduğunu etkileyebileceğine dair artan kanıtlar var. Ancak şu ana kadar B1525’in daha bulaşıcı olduğuna veya daha şiddetli hastalığa yol açtığına dair bir öneri yok.
B1525’te Q677H gibi kayda değer başka mutasyonlar da vardır. Bilim adamları bu değişikliği defalarca tespit ettiler – ABD’de farklı soylarda en az altı kez bu, virüse bir avantaj sağladığını, ancak herhangi bir faydasının doğası henüz belirlenmemiş olmasına rağmen.
B1525 varyantında, virüsün RNA’sındaki “harflerin” (G, U, A ve C) genomunda eksik olduğu birkaç silme işlemi de vardır.
Bu harfler, ilk olarak Kent, İngiltere’de tespit edilen varyant olan B117’de de eksik. Cambridge Üniversitesi’nde klinik bir mikrobiyolog olan Ravindra Gupta tarafından yapılan araştırma, bu delesyonların laboratuvar deneylerinde bulaşıcılığı iki kat artırabileceğini buldu.
Yakın zamanda ortaya çıktı
Birçok varyantta olduğu gibi, B1525 oldukça yakın zamanda ortaya çıkmış gibi görünüyor. Gisaid adlı paylaşılan küresel koronavirüs genom veri tabanındaki en eski örnek, 15 Aralık 2020 tarihine aittir. Birleşik Krallık’ta bir kişide tespit edilmiştir.
Ve birçok varyant gibi, B1525 de dünya çapında dikkat çekmeden önce dünyayı çoktan gezmişti. Bu varyantın Gisaid’deki toplam 204 sekansı 20 Şubat 2021 itibarıyla 18 ülkeye izlenebiliyor.
İki ülke (Danimarka ve Birleşik Krallık) vakaların yarısından fazlasını oluşturuyor, ancak bu iki ülke aynı zamanda çok sayıda koronavirüs genomunu da sıralamaktadır.
Çevrimiçi veritabanına bu varyantın en az bir genomunu girmiş olan diğer ülkeler Nijerya, ABD, Fransa, Kanada, Gana, Avustralya, Japonya, İtalya, Hollanda, Ürdün, Singapur, Finlandiya, İsviçre, Mayotte, Belçika ve İspanya’dır.
25 Şubat’ta İrlanda Cumhuriyeti ilk B1525 vakasını bildirdi.
Nijerya tarafından Gisaid’e toplam 31 B1525 genomu sunulmuştur.
Nijerya Hastalık Kontrol Merkezi’nden koronavirüs varyantları hakkında 19 Şubat 2021’de yapılan açıklamada, tespit edilen ilk B1525 genomunun 23 Kasım 2020’de Lagos Eyaletindeki bir hastadan toplanan bir numuneden olduğu, ancak numunenin olmadığı bildirildi. derhal veritabanına güncellendi, bu nedenle Birleşik Krallık örneği kaydedilen ilk örnek oldu.
Şimdiye kadar, varyant Nijerya’daki beş eyaletteki vakalar arasında tespit edildi. Nijerya’dan seyahat eden diğer ülkelerde de B1525 vakaları bildirilmiştir. Yani mutasyon ilk olarak Nijerya’da ortaya çıkmış olabilir.
Bir popülasyonda belirli bir varyantın yaygın olup olmadığını bilmek, belirli bir ülkede halk sağlığı ve politika kararları için yararlıdır. Ancak koronavirüsün evrimi dünya çapında meydana geldiğinden, damgalanmayı önlemek için bir varyantı bir ülkeyle ilişkilendirmekten kaçınmak en iyisidir.
Farklı frekans düzeni
Spesifik varyantların sıklığını tanımlamanın bir başka yolu, aynı anda dolaşımdaki diğer varyantlarla karşılaştırıldığında ne sıklıkla meydana geldiklerini belirlemektir. Bu varyantın ilk örneğinin o ülkede tespit edildiği tarihten itibaren tespit edilen B1525 dizilerinin sıklığına bakıldığında, farklı bir sıklık modeli ortaya çıkıyor.
Danimarka’da, 20 Şubat 2021 itibariyle, 12.222 sekansın 59’unu oluşturuyordu; İngiltere’de 100.063 diziden 57’si; ve Nijerya’da 144 dizinin 31’i.
Bu, varyantın muhtemelen Nijerya’da oldukça yaygın olduğunu, ancak Danimarka ve Birleşik Krallık’ta nadir olduğunu göstermektedir. Sekans verilerinin eksikliği, diğer ülkelerdeki frekansı maskeleyebilir.
Bununla birlikte, gezginlerden izole edilen virüslerin sıralanma olasılığı daha yüksekse, bu tür hesaplamalar önyargılı olabilir.
B1525’in frekansını ölçmek için hangi yolu seçersek seçelim, bu noktada nadir görülen bir varyant olarak kalır.
Ancak, endişelenmemiz gereken bir varyant olup olmadığını ve öyleyse varyantların lider panosunda nerede yer aldığını öğrenmek için laboratuvarda ve enfekte kişilerde ayrıntılı olarak incelenmesi gereken büyüyen bir koronavirüs varyantları listesine katılıyor. izlemek ve cevap vermek için.
Sharon Peacock, COVID-19 genomics UK Consortium (COG-UK) Direktörü ve Cambridge Üniversitesi Halk Sağlığı ve Mikrobiyoloji Profesörü.
Bu makale The Conversation’dan Creative Commons lisansı altında yeniden yayınlanmıştır. Orijinal makaleyi okuyun.
.