Vücuda alınan bir besinin bazı parçaları 'yabancı' olarak algılanarak bağışıklık sistemi uyarılır. Bu besine karşı IgE denilen antikorlar üretilir. Besin alerjilerinin bazıları IgE'ye bağlı, bazıları da değildir. IgE'ye bağlı besin alerjilerinin kaybolması daha uzun zaman alır. Ailede kuvvetli alerji öyküsünün olması bebek için de bir risk oluşturur. Ebeveynlerden birinde alerji olması yüzde 50, her ikisinde de olması yüzde 75 riski artırır.