Kütahya'nın Domaniç İlçesi'nin Çukurca Köyü'nde 1981 yılında dünyaya geldi. İlköğretimini köyünde, lise öğrenimini Tavşanlı'da tamamladı. İÜ İletişim Fakültesi Radyo TV Sinema Bölümü'nü 2003 yılında ikincilikle bitirdi. Aynı yıl İÜ Sosyal Bilimleri Enstitüsü Radyo TV Sinema Ana Bilim Dalı'nda yüksek lisansa başlayan Aytekin, "Korku Sinemasında Vampir Filmleri ve Korku Sinemasının Tarihsel Sürecinde Değişen Vampir İmgesi" başlık teziyle 2006 yılında yüksek lisansını, "Türk Milliyetçiliğinin Türk Sineması'na Yansıması (2005-2011)" isimli teziyle doktorasını tamamladı. 2014 yılındı İstanbul Üniversitesi İletişim Fakültesinde Yardımcı Doçent ünvanını aldı.
2007’de İÜ İletişim Fakültesi Radyo TV Sinema Bölümü'ne Araştırma Görevlisi olarak atandı. Birçok kısa film ve belgesel çalışması olan Aytekin, Reklamların İçinde/N, A Bridge of Intercultural Communication kitaplarında bölüm yazarlığı yapmıştır. KOCAV Yayınlarından çıkan Süleymaniye Sempozyumu (Şehir ve Medeniyet) kitabının editörlüğünü (Yrd. Doç. Dr. Mustafa Hakkı Ertan ve Dr. Ümran ay ile birlikte), Kültür Ocağında Bir Mütefekkir Erol Güngör ile Siyaset Sosyolojisi kitaplarının da genel yayın yönetmenliğini, Yeni(lenen) Medya isimli kitabın editörlüğü'nü yapmıştır.
KOCAV Bülteni ve Rengâhenk Dergisi'nin kurucuları arasında yer alan Aytekin, evli ve bir çocuk babasıdır.