Konfederasyon ordusu kaçarken Konfederasyon ordusunun komutanı ise ordusunun bir kısmını kendisini takip eden Birlik kuvvetlerini oyalaması için geride bırakmıştı. Böylece Konfederasyon komutanı ordusunu güvenli bir şekilde Yorktown civarlarından kaçırabilmeyi umuyordu. Arkada kalan Konfederasyon askerleri yerini almış ve Birlik kuvvetlerini beklemeye başlamıştı.
Birlik ordusu ise aynı gün içinde Konfederasyon ordusunun geride kalan kısmının savunmasını oluşturduğu Fort Magruder’e gelmişti. Birlik ordusu ilk saldırısına başladı ancak Konfederasyon ordusu tarafından geri püskürtüldü. Bunun üzerine savunmada bulunan Konfederasyon askerleri bir de saldırıya geçtiler. Bı karşı saldırıdan sonra Birlik ordusu için en büyük korku Konfederasyon askerlerinin topluca hücuma geçmesi olmuştu. Çünkü Birlik ordusunun o anda o bölgede bazı zayıflıkları vardı.