Küçük kemik kistlerini sadece takip etmek yeterlidir. Kemiğin içinde bulunan ve kırık riskini arttıran basit kemik kistleri ise genelde anestezi altında boşaltılır. Kistlerin içine iğne ile girilerek kist sıvısı boşatılır.Bundan sonra ise kist içine ortopedi uzmanının tercihine göre, steroid, hastadan alınan kemik iliği ya da demineralize kemik matriksinden biri enjekte edilir.