Ön eleme turuna 26 takım katıldı. FIFA Mauritius and Mozambik'in tekliflerini ödenmemiş borçlar yüzünden geri çevirdi, kalan 24 takım yarışmaya başladı. Lesotho, Ruanda ve Togo 12 Aralık 1987'de maç oynamadan çekildi. Libya ilk turu kazanıp ikinci tura geçti, ama çekildi ve çekilmeden önce yaptığı maçlar iptal edildi.
İkinci Tur: İlk turun sekiz birincisi en başarılı sekiz takım ile dört takımlı dört grup olarak eşleşti. Takımlar birbirleriyle rövanşlı eleme maçları oynadılar. Grup birincileri Final Turu'na yükseldi.