Mardin Müzesi, 1895 yılında Antakya Patriği Behnam Bani tarafından yaptırılmıştır. Süryani Katolik Patrikhanesi olarak inşa edilen 3 katlı yapıyı Kültür Bakanlığı satın almış ve 2000 yılında Mardin Müzesi olarak hizmete açmıştır.
Müze içinde ağırlıklı olarak arkeolojik kazılarda çıkarılan seramik, figür ve takılar ile çeşitli uygarlıklara ait kandil, mühür, sikke, cam şişe örnekleri sergileniyor.
Bahçesinde bulunan kuş kümesinde ise paçalı güvercinlerden, civcivlere hatta tavuskuşuna kadar kuş cinslerini görmek mümkün.