BİYOLOJİ HABERLERİ
Bakterilerin Gizli Kod Dili Ortaya Çıkarıldı
Patojenik bakterilerde(bulaşıcı hastalıklara neden olan bakterilerde) antibiyotik direnci gittikçe artan küresel bir zorluktur.
Danimarkalı araştırmacılar, bakterilerin kontrol edilmekten kaçınmak için bir kod dili kullandıklarını keşfettiler. Bu kod dilini anlamak, gelecekte yeni antibiyotikler geliştirmek için çok önemli olacaktır.
Patojen bakteriler - tüberküloz ve tifo ateşi yaratanlar gibi - bağışıklık sistemimize ve onları kontrol etmek için kullandığımız antibiyotiklere karşı çeşitli akıllıca numaralar kullanırlar. Bu akıllıca davranışlardan biri “gizlenme” . Gizlenme olayında, uyku durumuna geçerek bağışıklık siteminden ve işleyişten korunabilirler. Birkaç yıl boyunca, Aarhus Üniversitesi'ndeki araştırmacılar, bakterilerin bu şekilde gizlenmesini sağlayan moleküler mekanizmaları inceledi. Araştırmaya göre; kontrol edilmekten kaçınma çabalarında, kod dili kullandıkları ortaya çıkıyor.
Bir palindrome, aynı kelimenin hem ileri hem de geriye doğru okuduğunda değişmemesidir, örneğin "kayak”. Danimarka'nın Aarhus Üniversitesi'nde Moleküler Biyoloji ve Genetik Bölümü'nde araştırma ekibi olan Copenhagen Üniversitesi ve Aarhus Üniversitesi'nde bakteriyel fizyoloji ve biyoinformatik alanındaki diğer önde gelen araştırmacılar ile yakın işbirliği içerisinde ve Doçent Dr. Ditlev Egeskov Brodersen'in liderliğinde, çok sayıda patojenik bakteride, proteinlerindeki aminoasit dizisine gömülü kriptik palindromları kullanarak uyku hali durumuna geçilip geçilemeyeceğine karar verdiklerini keşfettiler.
Sonuçlar, Nucleic Acids Research dergisinde yayınlandı. Sonuçlar, antibiyotiklerle tedavi sırasında aktive olan spesifik hücre toksinlerinin ayrıntılı üç boyutlu yapılarını içeriyor ve bakteri hücrelerinin DNA'sının spesifik bölgelerine bağlandıklarında onlara ne olduğunu gösteriyor.
Toksinler genellikle "anti-toksinler" olarak adlandırılan ortaklar tarafından kontrol altında tutulur ve araştırmacılar, palindrom kodlarının anti-toksinlerin aynı anda iki toksini bloke etmesini sağladığını keşfettiler. Kodların aminoasit dizilimi anahtarın kilde uyması gibi uyar ve palindromik dizilim için gereklidir. Çünkü bloke edilecek iki toksin birbirine göre 180 derece döndürülür.
Ve dahası, bu tür kodların bakteriler arasında benzeri görülmemiş sayılarda mevcut olduğu görülüyor. Araştırmacılar, 4.000'den fazla bakteri genomunun analizinde, bilinen bakterilerin 1 / 4'ünün, hayatta kalma mücadelesinde bu tür kodları kullandıklarını ortaya koydu. Bu nedenle, araştırma sonuçları, gelecekte yeni antibiyotik geliştirme olasılıklarını arttırmak için bakterilerin kod dilini daha iyi anlamak gerektiğine işaret etmektedir.
Çeviren: Barış Uçar Bilime Yön Veren Cevaplar
Journal Reference:
- Kirstine L. Bendtsen, Kehan Xu, Majbritt Luckmann, Kristoffer S. Winther, Shiraz A. Shah, Christian N. S. Pedersen, Ditlev E. Brodersen. Toxin inhibition in C. crescentus VapBC1 is mediated by a flexible pseudo-palindromic protein motif and modulated by DNA binding. Nucleic Acids Research, 2016; gkw1266 DOI: 10.1093/nar/gkw1266
Kaynak: Aarhus University. "Secret code language of bacteria revealed." ScienceDaily. ScienceDaily, 21 December 2016. <www.sciencedaily.com/releases/2016/12/161221111342.htm>.
Kategorideki Diğer Başlıklar
D&R ve tüm seçkin kitapçılardan temin edebilirsiniz.