Júlio César, 3 Eylül 1979'da Rio de Janeiro'da doğdu ve bölgenin takımlarından Flamengo'da 6 sene boyunca forma giydi. Ayrıca bu süreçte Grajau adındaki bir takımda da futsal oynadı. Kulüplerde geçirdiği yılların ardından 2005 yılında Inter Milan'a transfer oldu. İlk senesinde AB'li olmayan ülke oyuncuları ile ilgili olan sınırlama nedeniyle bir sene boyunca Chievo Verona'da oynamak zorunda kaldı. Burada olduğu 6 ayda forma giymeyen kaleci, 2005 sonunda Inter Milan'la olan kontratını 3 yıllığına yenileyerek takımın bir üyesi oldu. Dostluk maçlarında ve resmî turnuvalarda sergilediği performanslarla kaleci Francesco Toldo'yu geride bıraktı ve as kaleci olarak görev yapmaya başladı.
29 Ağustos 2012 tarihinde kulübü Inter tarafından sözleşmesi feshedilen Júlio César yeni bir yapılanmaya giderek önemli transferler gerçekleştiren Queens Park Rangers'a transfer olmuştur. 4 yıllık sözleşmeye imza atan oyuncunun transferi için bonservis ücreti ödenmemiştir.