İmar Bankası ile ilgili belirsizliklere şimdi de ‘vergi belirsizliği’ eklendi. Tasfiye kararı ile 3 Temmuz 2003 tarihinde inceleme alınan İmar Bankası'nda ortaya çıkan 8 katrilyon lira seviyesindeki ‘bildirim ve hesap dışı’ paranın devlete ödenmesi gereken vergisi ile ilgili ciddi sorunların olduğu belirtildi. TMSF'nin İmar Bankası'na atadığı yönetim, Maliye Bakanlığı ile arasında oluşan bu vergi sorunu nedeniyle ek süre talebinde bulundu. Tasarruf Mevduatı Sigorta Fonu'nca (TMSF) atanan yönetim; İmar Bankası hesaplarını vergisel yükümlülükler açısından inceleyen müfettişlerden ‘mücbir sebep’ gerekçesiyle ek süre talebinde bulundu. Banka yönetimi, kısa bir süredir işbaşında olduklarını belirterek; kayıtların sağlıksız olması nedeniyle, vergi beyannamelerine esas oluşturacak kazançların henüz saptanamadığını bildirdi. Maliye Bakanlığı da İmar Bankası'nın vergi beyannamelerini verebilmesi için, Vergi Usul Yasası'nın ‘‘vergi ödevlerinin yerine getirilemeyeceği durumlarda, yasal sürenin bir misli ek süre verilmesini’’ öngören hükmü uyarınca 30 Kasım 2003 tarihine kadar ek süre verdi.
Bir yetkili sorunu şöyle anlattı: ‘‘İki yıl önce yüzde 60'lar seviyesinde olan mevduat faizi bu yıl yüzde 30'lara düşmüş mü, düştüyse bunun kayıdı var mı? Faiz oranları mevduat cüzdanında yazmadığına göre sadece bunu saptamak bile çok zaman alır.’