6.6: Kesintili İplik Sentezi
Replikasyon sırasında, çift iplikli DNA'daki tamamlayıcı iplikçikler farklı oranlarda sentezlenir. Çoğaltma ilk önce önde gelen iplikçikleriyle başlar. Çoğaltma daha sonra başlar, daha yavaş gerçekleşir ve gecikmeli iplikçik üzerinde süreksiz bir şekilde ilerler.
Önde gelen ipliğin sentezi ile gecikmeli ipliğin sentezi arasında birkaç önemli fark vardır. 1) Önde gelen iplikçik sentezi, çoğaltma çatalı açıklığı yönünde gerçekleşirken, gecikmeli iplikçik sentezi ters yönde gerçekleşir. 2) Önde gelen iplikçik sentezi için tek bir astara ihtiyaç duyulurken, gecikmeli iplikçik sentezi için çoklu RNA primerleri gereklidir. 3) İlk primer sentezinden sonra, önde gelen iplikçik replikasyonun devam etmesi için sadece DNA polimerazına ihtiyaç duyarken, geri kalan iplikçik DNA polimeraz I, Rnaz H ve ligaz dahil olmak üzere çoklu enzimlere ihtiyaç duyar. 4) Önde gelen iplikçik sürekli bir parça olarak sentezlenirken, gecikmeli iplikçik Okazaki fragmanları adı verilen bir dizi kısa parça olarak sentezlenir. Bu nedenle, gecikmeli iplikçik sentezi, farklı moleküller arasında karmaşık koordinasyonu içeren çok adımlı bir süreçtir.
Prokaryotların ve ökaryotların farklı genom boyutları nedeniyle, iplikçik sentezinin gecikmesi süreci aralarında farklılık gösterir. En belirgin fark Okazaki parçalarının uzunluğudur. Okazaki fragmanının ortalama uzunluğu prokaryotlarda yaklaşık 1000 ila 2000 nükleotittir, ancak ökaryotlarda sadece 100 ila 200 nükleotittir.