Sao Tome ve Principe genel olarak güvenli bir ülkedir. Turizmin popülerleşmesi ile birlikte özellikle turistlerin yoğun olarak ziyaret ettiği bölgelerde kap kaç olaylarında artış gözlemlenmiştir. Sürücüler trafik kurallarına çok uymadıkları için sokakta yürürken dikkat etmeniz önerilmektedir. Sao Tome ve Principe'de en yaygın görülen salgın hastalık sıtmadır. Bu nedenle gitmeden önce aşılarınızı yaptırmanız önerilmektedir. Sivrisineklere karşı koruyucu sprey ya da krem bulundurmanızda ve şişelenmiş su içmenizde yarar vardır.