Şeker hastalığı ameliyatı yani metabolik cerrahi ile obezite ameliyatının benzer birçok yönü olmasına rağmen farklı yönleri de bulunmaktadır. Bu farkların en başında; şeker hastalığını daha iyi kontrol edebilmesi ve devre dışı bırakılan bir bağırsak sistemi olmadığı için emilim sorunu yaşanmaması, ameliyat sonrasında da buna bağlı olarak çok fazla ilaç ve vitamin takviyesine ihtiyaç duyulmaması gelmektedir.