Yönetim kurulu Ajansın karar organıdır. Birden fazla ilden oluşan bölgelerde il valileri, il büyükşehir belediye başkanları ve her ilden birer kişi olmak kaydıyla ticaret ve sanayi odası başkanlarından oluşur. GEKA Yönetim Kurulu Başkanlığı ilgili mevzuat kapsamında Denizli’den başlayarak sırasıyla Muğla, Aydın Valileri tarafından dönüşümlü olarak yürütülmektedir.
Ajansımızın Yönetim Kurulu Başkanlığını Aydın Valisi Sayın Hüseyin AKSOY yürütmektedir.