Hoca Sadeddin Efendi, 1536-1537 yıllarında doğdu. Yavuz Sultan Selim'in nedimi Hasan Can'ın oğludur. İlk öğrenimini, Karamani Mehmed Efendi'den ve devrin ileri gelen bazı bilginlerinden aldı. Bursa Yıldırım medresesine tayin edildi. 1572'de Sahn müderrisliğine getirildi. Şehzade Murad'a hocalık etmesi için Manisa'ya gönderildi. Kısa süre sonra Sultan Üçüncü Murad tahta çıkınca, Hace-i Sultani oldu. Sultan Üçüncü Murad öldükten sonra da Hoca Sadeddin Efendi ünvanını ve nüfusunu korudu.
Sultan Üçüncü Mehmed zamanında da hakim durumda olan Hoca Sadeddin Efendi, Eğri Seferi'nde padişahı ordunun başında hareket ettirmesi ve Haçova zaferinin kazanılmasında önemli rol oynadı. Haçova zaferi onun nüfusunu daha da arttırdı. Savaş sırasında başarılı olduğu için sadarete getirttiği Sinan Paşa'nın bir takım hataları, Hoca Sadeddin'in gözden düşmesine yol açtı. Fakat bir süre sonra şeyhülislamlık makamına getirildi. Kendisine düşmanlık edenlerden intikam aldı. Müftü sıfatı ile fetva tahririnde büyük bir sürat ve başarı gösterdi. 1599 yılında vefat etti.