Ardından ise bu dönem başta muhafazakâr kesime karşı başörtüsü yasağı gibi uygulamalara sahne olmuş, başörtülü öğrenciler okullardan atılmış, ikna odaları kurulup başlarını açmaları için zorlanmış ve çok sayıda kamu personeli işinden irtaca nedeniyle atılmıştır. "İrticayla mücadele eylem planı" ile anılan bu süreçte verilen kararların ve yaptırımların uygulanıp uygulanmadığı denetlemek için Çevik Bir öncülüğünde Batı Çalışma Grubu kurulmuştur. 16 Ocak 1998 yılında Millî Görüş'ün siyasî arenadaki temsilcisi olan Fazilet, RP (yedek parti) kapatılmadan siyasette sahneye çıkmıştır. 17 Aralık 1997'de kurulan FP'ye, RP'nin birçok milletvekili ve belediye başkanı katılmış, ancak, bu parti de "RP'nin devamı olduğu gerekçesiyle kapatılma davası açılmaktan kurtulamamıştır. Anayasa Mahkemesi FP'yi de 22 Haziran 2001 tarihinde kapatmıştır. 4 Ağustos 2001'de AKP (Adalet ve Kalkınma Partisi) kurulmuş, kendilerini ANAPın devamı gibi lanse edip kendini muhafazakâr demokrat ilan etmiştir. Fakat Kurucuları ve önde gelen isimlerinden bir bölümü, eski Fazilet Partisine yakın ya da Fazilet Partisi kadrosundan olup bu partinin kapatılmasından sonra kurulan ve devam niteliğine sahip olduğu kabul edilen Saadet Partisine katılmayanlardır. 4 Ağustos 2001 tarihinde kurulan bu partinin kurucuları arasında Recep Tayyip Erdoğan, Abdullah Gül, Abdüllatif Şener, İdris Naim Şahin, Binali Yıldırım ve Bülent Arınç bulunur. Bünyesinde Millî Selamet Partisi-Refah Partisi-Fazilet Partisi (Millî Görüş), Anavatan Partisi (Turgut Özal'a yakın isimler) ve Demokrat Parti-Adalet Partisi-Doğru Yol Partisi (merkez sağ) kökenli isimleri barındırmaktadır.