Beyinde nöronlar (sinir hücreleri) arasındaki iletişim, aksonlar (sinir lifleri) aracılığıyla olur. Aksonlar, beyinde belirli yolaklar (sinir lif demetleri) boyunca ilerleyip, nöron kümelerinin anatomik ve fonksiyonel bağlantısını sağlarlar.
Akson demetlerinden oluşan bu yolaklar, beyin fonksiyonlarının sağlıklı şekilde yürütülmesi için çok önemlidir. Bu yolakların herhangi bir nedenle hasar görmesi, ciddi zihinsel fonksiyon kayıplarına neden olur. MR traktografi, akson yolaklarının 3-boyutlu görüntüleme ve haritalama yöntemidir. MR traktografi`yi, özellikle beyin arterio-venöz malformasyon (damar yumağı) ve beyin tümörü hastalarının tedavi planlamasında kullanılır.
MR traktografi ile lezyonların beyindeki önemli akson yolakları arasındaki anatomik yakınlığı belirlenir, tedavi bu yolaklara zarar vermeyecek şekilde planlanlanır.