Uyku sırasında beyinin biyoelektrik aktivitesi tamamen değişir. Uykunun farklı dönemleri vardır ve bu dönemlere özgü EEG değişiklikleri saptanır. Uyku beyindeki anormal elektriksel aktivitenin ortaya çıkmasına yardımcı olur.
Bebeklerde ve çok küçük yaştaki çocuklarda uykuda EEG kayıtları çok daha değerlidir ve bu nedenle çocuklarda EEG incelemesi mümkün ise en az 1 saat uykuda EEG kaydı içermelidir.