Tom Cruise’un Miscavige ile olan yakın ilişkisi, Nicole Kidman’ın mesafeli tutumu ve Tom Cruise’un kiliseye yakın olmasından duyduğu rahatsızlık, auditing seanslarında Cruise’a boşanması yönünde telkinler yapıldığı, belgeselde aktarılan diğer konulardan. Özel dedektiflerin Nicole Kidman’ın telefonlarını dinledikleri, eve dinleme cihazları yerleştirdikleri, evlatlık çocuklarını annelerine karşı kilisenin kışkırttığı anlatılıyor. Tom Cruise’un daha sonra kilisenin onayladığı bir başka kadınla olan ilişkisine de değiniliyor.
Belgeselin en ilginç bölümlerden biri ise Scientology’nin IRS (Milli Gelirler Tahsil Dairesi) ile olan savaşı. Kilisenin kurucusu Hubbard, Scientology’yi kar amacı gütmeyen bir kuruluş olarak ilan ederek, vergiden muaf olduğunu iddia etmişti. Miscavige ise, binlerce Scientology müridini IRS’e dava açmaya yönlendirdi. Sonuçta, kazanan Scientology kilisesi oldu, IRS Scientology’nin vergiden muaf olduğunu kabul etti.