Deniz akvaryumlarında ortalama ısı 26-27 derece aralığındadır. Yüksek ısılar omurgasızların dağılma ve bozulma süreçlerini hızlandırmaktadır. Fakat düşük ısılar özellikle bakteri kültürünü olumsuz etkilemektedir.
Yani ısı 22-23 derecenin altına indiği zaman içeride sıkıntılar başlar. 28 derecenin üzerine çıktığı zaman da sert mercan gruplarında dağılmalar başlar. Bu yüzden iki tür sistem kullanılır. Birisi ısıtma diğeri de klima sistemidir.
Isıtma sistemi stabil olarak kalibre edilir ve 27 dereceye sabitlenir. Yazın bu derecenin üstüne çıkmaması için soğutucu kullanılır.