Şanidar Mağarası (Kürtçe: Şaneder veya Zewî Çemî Şaneder; Arapça: كهف شاندر) Irak'ın Kürdistan Bölgesel Yönetimi'de Bradost Dağı'nda bulunan bir arkeolojik sit alanı.
35.000, 65.000 yıl öncesine kadar uzanan on neandertalin kalıntıları içinde bulunmuştur. Neandertaller, ölülerini ilk gömdüğü kanıtlanan ilk homo türüdür. Topluluk tarafından önemli kabul edilen (?) bir kişinin özellikle şifalı ot ve çiçeklerle beraber törenle gömülmesi ile belgelenmiştir. Ancak bu kişinin bilerek çiçeklerle bezenmediği, çiçeklerin sonradan oluştuğu veya kişi hastayken, yani henüz hayattayken iyileşmesi için konulduğu ihtimali de bulunmaktadır. Neandertaller yaşam tarzları gereği sıkça yaralandıkları için iyileştirme tekniklerinde ileri bir türdü. Şanidar Mağarası'nda tespit edilen neandertal kültürünün Rusya steplerinden gelmiş olabileceği düşünülmektedir.
Erbil ilinde Zagros Dağları içinde, Zap Suyu vadisine yakın bir konumda bulunmaktadır.