Ağız kokusunun çok çeşitli sebepleri olabilir. Koku sadece ağız veya dişlerden kaynaklanmayabilir. Mide ve akciğer hastalıklarında, boğaz enfeksiyonlarında, veya bazı sistemik hastalıklarda örneğin diyabette ağız kokusu olabilir. Bazen de hastalar ağız kokusundan şikayet eder, ağzının koktuğunu zannedebilir.
Ağız kokusu hastalıklarında hekim iyi bir muayene yapmalı, kokunun nereden kaynaklanabileceğini tespit edip ona göre hastayı yönlendirmelidir. Ağız içindeki koku çürüklerden, diş taşlarından, kötü yapılmış veya eskimiş restorasyonlardan kaynaklanabilir. Bu etkenler ağızdan uzaklaştırılıp tedaviler doğru şekilde sonlandırılırsa ağız kokusu sorunu çözümlenecektir.