Ekzom dizileme yöntemi, genomun sadece protein kodlayan bölümlerinin dizileminin çıkartılmasını kapsar. DNA’nın kodlanan bölgelerinin tamamı olarak adlandırabileceğimiz ekzom, insan genomunun %2’sinden daha azını oluşturmasına rağmen büyük oranda hastalığa sebep olduğu bilinen varyasyonlar içermektedir. Bu sebeple, bütün genomun çıkartılmasının gerekli olmadığı durumlarda ekzom dizileme yöntemi hem daha hızlı hem de daha az maliyetli bir alternatif olarak kullanılabilir.