text: （1998年7月、MAGコミックス、マガジンハウス）諸星大二郎自選短編集 諸星大二郎自選短編集I 汝、神になれ鬼になれ（2001年1月、ヤングジャンプ愛蔵版、集英社）諸星大二郎自選短編集II 彼方より（2001年3月、ヤングジャンプ愛蔵版、集英社）碁娘伝（2001年10月、希望コミックス、潮出版社）私家版鳥類図譜（2003年3月、KCデラックス、講談社）新装版 私家版鳥類図譜 (KCデラックス モーニング) (2016年11月22日、講談社）トゥルーデおばさん グリムのような物語（2006年2月、眠れぬ夜の奇妙な話コミックス、朝日ソノラマ）スノウホワイト グリムのような物語（2006年11月、東京創元社）私家版魚類図譜（2007年3月、KCデラックス、講談社）新装版 私家版魚類図譜 (KCデラックス モーニング) （2016年11月22日、講談社）未来歳時記・バイオの黙示録 (2008年7月、ヤングジャンプコミックス、集英社)  巨人譚 (2008年12月、光文社コミック叢書SIGNAL、光文社)  闇の鶯 (2009年4月、KCデラックス、講談社)  諸星大二郎 ナンセンスギャグ漫画集・珍の巻（2010年3月、ジャイブ）諸星大二郎 ナンセンスギャグ漫画集・妙の巻（2010年3月、ジャイブ）諸星大二郎特選集 第1集・男たちの風景 （2013年10月、小学館）第2集・子供の情景 （2013年11月、小学館）第3集・遠い世界 （2013年12月、小学館）第4集・蒼の群像 （2015年3月、小学館）瓜子姫の夜・シンデレラの朝（2013年12月、朝日出版社）あもくん（2015年3月30日、角川書店 幽COMICS）夢のあもくん（2022年3月30日、KADOKAWA、怪と幽COMICS）BOX -箱の中に何かいる- (1)　（2016年11月22日、講談社 モーニングKC）(2)　（2017年4月21日、講談社 モーニングKC）(3)　（2017年10月23日、講談社 モーニングKC）諸星大二郎劇場（短編集）第1集 雨の日はお化けがいるから（2017年12月27日、小学館 ビッグコミックススペシャル）第2集 オリオンラジオの夜（2019年1月30日、小学館 ビッグコミックススペシャル）第3集 美少女を食べる（2020年11月30日、小学館 ビッグコミックススペシャル）第4集 アリスとシェエラザード（2022年3月30日、小学館 ビッグコミックススペシャル）幻妖館にようこそ（自選短編集+書き下ろし新作、2019年4月17日、MANGATRIX）妖怪ハンターシリーズ  妖怪ハンター（『生命の木』『生物都市』収録）（1978年7月、ジャンプスーパーコミックス、集英社）- ウルトラジャンプ2014年3月号付録として復刻