text: 本明川、相浦川、佐々川 海域 玄界灘、対馬海峡、壱岐水道、伊万里湾、平戸瀬戸、辰ノ瀬戸 五島灘、角力灘、長崎湾、佐世保湾、針尾瀬戸、早岐瀬戸、大村湾 橘湾（千々石湾）、早崎瀬戸、島原湾、諫早湾、有明海、 東シナ海 島（太字のものは、橋によって九州本土と結ばれている島を表す）対馬（対馬市）壱岐島（壱岐市）福島、鷹島、青島（松浦市）平戸島、生月島、度島、的山大島、二神島（平戸市）九十九島 (西海国立公園)（くじゅうくしま）、黒島、針尾島（佐世保市）五島列島 宇久島（佐世保市宇久町）小値賀島、野崎島（北松浦郡小値賀町）中通島、若松島（南松浦郡新上五島町）奈留島、久賀島、福江島（五島市）男女群島、鳥島（五島市）大島、蛎浦島、崎戸島、江島、平島、松島（西海市）池島（長崎市）伊王島、高島、端島（軍艦島）、樺島（長崎市）九十九島（つくもじま、島原市）自然公園  国立公園 雲仙天草国立公園、西海国立公園 国定公園 壱岐対馬国定公園、玄海国定公園 県立自然公園 多良岳県立公園、野母崎半島県立公園、北松県立公園、大村湾県立公園、西彼杵半島県立公園、島原半島県立公園 気候  南西方向から暖流の対馬海流が流入してくるため、全般的には気候は温暖で寒暖差も小さい。しかし大陸に近いために寒波の影響を受けやすく、平年を大きく下回るほどに寒さが厳しくなることもあり、真冬日が観測されることもある。冬場は東シナ海側を中心に曇りがちの天気になることが多く、時雨や雪を降らせることがある。積雪することは少ないが、すぐ西側は東シナ海なので季節風（モンスーン）の風向によっては、雪雲が遮られずに供給されることにより大雪となることがある。特に2001年（平成13年）1月16日には長崎市で約14cmの積雪を観測し、過去に約15㎝の積雪が5回もあり、2016年（平成28年）1月24日には約17cmの積雪を記録し、県内各地で大雪となった。しかし、九州地方最北端の対馬では朝鮮半島のすぐ南側に位置するため、東シナ海で発生した雪雲は朝鮮半島に遮られる上、朝鮮半島との海上区間はわずか50km程と極端に短いため雪雲は発達せず、降雪日は多いものの積雪することは稀である。生物的見地から見ると、各地の海岸に見られるアコウなどの亜熱帯性植物は温暖な気候を反映している。他にも大陸に近いためツシマヤマネコやムツゴロウなどの大陸系遺存種が多いこと、各地の離島で多くの亜種・変種が確認されていることなども特徴である。