Le campus du Collège de France à Ankadilalana représente le pôle secondaire de l'institution, accueillant les élèves de la classe de la 6ème jusqu'à la Terminale. Contrairement au site d'Amparibe dédié aux plus petits, cet établissement se concentre sur les enjeux de l'adolescence et la préparation aux examens officiels tels que le Brevet et le Baccalauréat français.

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