Вы закрыли заметку, ничего не редактировав на карте? 

Если помелок упразднён, это значит, что либо его нужно перевести в locality (если он уже польностью нежилой), либо добавить его внешний контур в роли outer к другому населенному пункту (если посёлок был включен в границы другого НП).

Не закрывайте заметку просто ради "чистой карты" -- пусть она висит  и дожидается того редактора, кто сможет ее осмысленно закрыть.