Когда я пишу про "слить", надо объединить точки, а не просто удалить одну из них. На них разные наборы тегов могут быть, как например в данном случае. Здесь я редактировал из Every Door, в этом редакторе нет функции оъединения точек. В нормальных редакторах типа JOSM она есть - "Merge Nodes". В iD можно перетащить одну точку на другую, но он конфликтные значения тегов через ";" оба сохранит, надо это заметить и какое-то одно оставить. JOSM в таком случае показывает диалог.

Просто удалить из Every Door легко можно, мне бы заметку оставлять не понадобилось.