#!/usr/bin/env python
import argparse

from gcounter.utils import process_sam


def get_arguments():
    parser = argparse.ArgumentParser()
    parser.add_argument('file_path')
    parser.add_argument('output_file')
    args = parser.parse_args()
    return args



if __name__ == '__main__':
    args = get_arguments()
    process_sam(args.file_path,
                args.output_file)
