والأمر الأكثر أهمية هو أن تعمل مثل هذه الأنظمة بأمان. ففي أغلب تطبيقات التمثيل الضوئي الاصطناعي يتم إنتاج الوقود الغني بالطاقة مع الأكسجين، وهو ما يسفر عن خليط متفجر بالغ الخطورة. لذا فلابد من تطوير أغشية أو غير ذلك من الحواجز المادية والكيميائية من أجل عزل المنتجات عن بعضها البعض بطريقة جديرة بالثقة. وهذه الأولويات من شأنها أيضاً أن تقضي على الحاجة إلى معدات معالجة طرفية معقدة التي تشكل ضرورة لفصل المنتجات قبل استخدامها في أغلب التطبيقات.
Proto je nutné vyvinout membrány nebo jiné fyzické a chemické bariéry, aby se jednotlivé produkty spolehlivě izolovaly. Tyto dělicí mechanismy by zároveň eliminovaly potřebu složitého vybavení pro zpracování rozhraní, které by u většiny aplikací bylo nutné k separaci produktů před jejich použitím.