1959 में, पेरेज़ पूर्णकालिक रूप से राजनीति में आ गए, और उन्होंने बेन गुरियन का लेबर पार्टी के पुराने दिग्गजों के साथ संघर्ष में समर्थन किया। बाद में, वे क्नेसेट, इज़रायल की संसद के लिए निर्वाचित हुए, और उप रक्षा मंत्री बने और बाद में कैबिनेट के पूर्ण सदस्य बन गए।
V roce 1959 se Peres začal věnovat politice naplno a podpořil Ben-Guriona ve střetu se starou gardou Strany práce. Později byl zvolen do Knesetu, izraelského parlamentu, a stal se nejprve náměstkem ministra obrany a později plnoprávným členem kabinetu.