नाइजीरिया में आधिकारिक रूप से स्वीकृत समलैंगिकता के विरोध के वातावरण ने एड्स के खिलाफ लड़ाई में पहले ही अड़चन डाल दी है। 2006 में, एक अध्ययन से पता चला था कि नाइजीरिया में पुरुषों के साथ यौन संबंध रखने वाले पुरुषों में 13% एचआईवी पॉज़िटिव हैं, जबकि इसकी तुलना में कुल नाइजीरियाई व्यक्तियों में से 4.5% एचआईवी पॉज़िटिव हैं। 2012 तक, पुरुषों के साथ यौन संबंध रखने वाले पुरुषों के बीच एचआईवी की दर बढ़कर 17% हो गई। इस बीच, स्वास्थ्य केन्द्रों पर अधिक संख्या में पुरुषों ने बताया कि उन्हें समलैंगिकता के विरोध के वातावरण का सामना करना पड़ रहा है, जिसके कारण इसकी संभावना कम है कि वे मदद प्राप्त करने के लिए आगे आएँगे।
Do roku 2012 se procento nakažených mužů majících sex s muži zvýšilo na 17%. Stále vyšší počet mužů přitom uvádí, že se ve zdravotnických centrech setkává s homofobií, což snižuje pravděpodobnost, že vyhledají pomoc.