To understand why, consider that their proposal for a permanent Council President was paired with a proposal that the Commission President--currently nominated by the Council of Ministers--should in future be elected by the European Parliament, and subsequently be endorsed by a majority vote of the Council of Ministers.
Um zu verstehen, warum, halte man sich vor Augen, dass mit dem ständigen Ratspräsidenten zugleich auch vorgeschlagen wurde, den Kommissionspräsidenten - der momentan vom Ministerrat nominiert wird - in Zukunft vom Europäischen Parlament zu wählen und anschließend durch einen Mehrheitsbeschluss des Ministerrates zu bestätigen.