1959 में, पेरेज़ पूर्णकालिक रूप से राजनीति में आ गए, और उन्होंने बेन गुरियन का लेबर पार्टी के पुराने दिग्गजों के साथ संघर्ष में समर्थन किया। बाद में, वे क्नेसेट, इज़रायल की संसद के लिए निर्वाचित हुए, और उप रक्षा मंत्री बने और बाद में कैबिनेट के पूर्ण सदस्य बन गए।
Dabei unterstützte er Ben-Gurion in seinem Konflikt mit der alten Garde der Arbeiterpartei. Später wurde er in die Knesset (das israelische Parlament) gewählt und wurde stellvertretender Verteidigungsminister und in der Folge Vollmitglied des Kabinetts.