Als bestuursvoorzitter van het Global Fund to Fight AIDS, Tuberculosis, and Malaria tussen 2009 en 2011, en als voorzitter van de Roll Back Malaria Partnership tussen 2007 en 2009, heeft Ghebreyesus er ingrijpende veranderingen doorheen gedrukt, die de activiteiten van beide organisaties drastisch hebben verbeterd.
Como Presidente de la Junta del Fondo Global para la lucha contra el SIDA, la Tuberculosis y la Malaria entre 2009 y 2011, y como Presidente de la Alianza para Hacer Retroceder el Paludismo entre 2007 y 2009, Ghebreyesus impulsó amplios cambios que mejoraron radicalmente las operaciones de las organizaciones.